Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWA3

Ulbp1, UL16 binding protein 1, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulbp1Q8HWA3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ulbp1Q8HWA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ulbp1Q8HWA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ulbp1Q8HWA3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Ulbp1Q8HWA3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ulbp1Q8HWA3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ulbp1Q8HWA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ulbp1Q8HWA3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ulbp1Q8HWA3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ulbp1Q8HWA3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ulbp1Q8HWA3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ulbp1Q8HWA3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ulbp1Q8HWA3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ulbp1Q8HWA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ulbp1Q8HWA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ulbp1Q8HWA3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ulbp1Q8HWA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Ulbp1Q8HWA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ulbp1Q8HWA3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ulbp1Q8HWA3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ulbp1Q8HWA3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ulbp1Q8HWA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ulbp1Q8HWA3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ulbp1Q8HWA3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ulbp1Q8HWA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ulbp1Q8HWA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Ulbp1Q8HWA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ulbp1Q8HWA3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ulbp1Q8HWA3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ulbp1Q8HWA3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Ulbp1Q8HWA3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ulbp1Q8HWA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ulbp1Q8HWA3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ulbp1Q8HWA3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ulbp1Q8HWA3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ulbp1Q8HWA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ulbp1Q8HWA3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ulbp1Q8HWA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Ulbp1Q8HWA3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ulbp1Q8HWA3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ulbp1Q8HWA3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ulbp1Q8HWA3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ulbp1Q8HWA3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ulbp1Q8HWA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ulbp1Q8HWA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ulbp1Q8HWA3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ulbp1Q8HWA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ulbp1Q8HWA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ulbp1Q8HWA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ulbp1Q8HWA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ulbp1Q8HWA3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ulbp1Q8HWA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ulbp1Q8HWA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ulbp1Q8HWA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Ulbp1Q8HWA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ulbp1Q8HWA3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ulbp1Q8HWA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ulbp1Q8HWA3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ulbp1Q8HWA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ulbp1Q8HWA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ulbp1Q8HWA3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ulbp1Q8HWA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ulbp1Q8HWA3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ulbp1Q8HWA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ulbp1Q8HWA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,55■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Ulbp1Q8HWA3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ulbp1Q8HWA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ulbp1Q8HWA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ulbp1Q8HWA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms