Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50,8■■■■■ 5,72
Cc2d2aQ8CFW7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,78■■■■■ 5,72
Cc2d2aQ8CFW7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC50,76■■■■■ 5,72
Cc2d2aQ8CFW7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC50,67■■■■■ 5,7
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,62■■■■■ 5,69
Cc2d2aQ8CFW7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC50,61■■■■■ 5,69
Cc2d2aQ8CFW7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC50,53■■■■■ 5,68
Cc2d2aQ8CFW7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50,48■■■■■ 5,67
Cc2d2aQ8CFW7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC50,47■■■■■ 5,67
Cc2d2aQ8CFW7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC50,43■■■■■ 5,66
Cc2d2aQ8CFW7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,33■■■■■ 5,65
Cc2d2aQ8CFW7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,3■■■■■ 5,64
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC50,29■■■■■ 5,64
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC50,26■■■■■ 5,64
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC50,24■■■■■ 5,63
Cc2d2aQ8CFW7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC50,2■■■■■ 5,63
Cc2d2aQ8CFW7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,14■■■■■ 5,62
Cc2d2aQ8CFW7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC50,13■■■■■ 5,62
Cc2d2aQ8CFW7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,02■■■■■ 5,6
Cc2d2aQ8CFW7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC50,01■■■■■ 5,6
Cc2d2aQ8CFW7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC49,98■■■■■ 5,59
Cc2d2aQ8CFW7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC49,93■■■■■ 5,58
Cc2d2aQ8CFW7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,91■■■■■ 5,58
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC49,91■■■■■ 5,58
Cc2d2aQ8CFW7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC49,89■■■■■ 5,58
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC49,86■■■■■ 5,57
Cc2d2aQ8CFW7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC49,86■■■■■ 5,57
Cc2d2aQ8CFW7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,74■■■■■ 5,55
Cc2d2aQ8CFW7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,64■■■■■ 5,54
Cc2d2aQ8CFW7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,63■■■■■ 5,53
Cc2d2aQ8CFW7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,6■■■■■ 5,53
Cc2d2aQ8CFW7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC49,58■■■■■ 5,53
Cc2d2aQ8CFW7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC49,53■■■■■ 5,52
Cc2d2aQ8CFW7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,5■■■■■ 5,52
Cc2d2aQ8CFW7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49,45■■■■■ 5,51
Cc2d2aQ8CFW7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,45■■■■■ 5,51
Cc2d2aQ8CFW7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC49,44■■■■■ 5,5
Cc2d2aQ8CFW7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC49,42■■■■■ 5,5
Cc2d2aQ8CFW7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC49,4■■■■■ 5,5
Cc2d2aQ8CFW7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,3■■■■■ 5,48
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,3■■■■■ 5,48
Cc2d2aQ8CFW7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC49,3■■■■■ 5,48
Cc2d2aQ8CFW7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,29■■■■■ 5,48
Cc2d2aQ8CFW7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,27■■■■■ 5,48
Cc2d2aQ8CFW7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC49,25■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC49,23■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC49,23■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC49,23■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,21■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC49,2■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC49,2■■■■■ 5,47
Cc2d2aQ8CFW7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49,19■■■■■ 5,46
Cc2d2aQ8CFW7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,18■■■■■ 5,46
Cc2d2aQ8CFW7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49,18■■■■■ 5,46
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC49,17■■■■■ 5,46
Cc2d2aQ8CFW7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC49,08■■■■■ 5,45
Cc2d2aQ8CFW7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,06■■■■■ 5,44
Cc2d2aQ8CFW7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC49,06■■■■■ 5,44
Cc2d2aQ8CFW7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC49,04■■■■■ 5,44
Cc2d2aQ8CFW7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49,02■■■■■ 5,44
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,98■■■■■ 5,43
Cc2d2aQ8CFW7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,94■■■■■ 5,42
Cc2d2aQ8CFW7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,91■■■■■ 5,42
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC48,9■■■■■ 5,42
Cc2d2aQ8CFW7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,88■■■■■ 5,42
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC48,87■■■■■ 5,41
Cc2d2aQ8CFW7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC48,82■■■■■ 5,41
Cc2d2aQ8CFW7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC48,8■■■■■ 5,4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC48,8■■■■■ 5,4
Cc2d2aQ8CFW7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC48,78■■■■■ 5,4
Cc2d2aQ8CFW7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC48,75■■■■■ 5,39
Cc2d2aQ8CFW7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,73■■■■■ 5,39
Cc2d2aQ8CFW7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,73■■■■■ 5,39
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,7■■■■■ 5,39
Cc2d2aQ8CFW7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,68■■■■■ 5,38
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,67■■■■■ 5,38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC48,67■■■■■ 5,38
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,61■■■■■ 5,37
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48,61■■■■■ 5,37
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
Cc2d2aQ8CFW7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48,55■■■■■ 5,36
Cc2d2aQ8CFW7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,47■■■■■ 5,35
Cc2d2aQ8CFW7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC48,45■■■■■ 5,35
Cc2d2aQ8CFW7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,43■■■■■ 5,34
Cc2d2aQ8CFW7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC48,4■■■■■ 5,34
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC48,39■■■■■ 5,34
Cc2d2aQ8CFW7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,37■■■■■ 5,33
Cc2d2aQ8CFW7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC48,36■■■■■ 5,33
Cc2d2aQ8CFW7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,33■■■■■ 5,33
Cc2d2aQ8CFW7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC48,3■■■■■ 5,32
Cc2d2aQ8CFW7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,29■■■■■ 5,32
Cc2d2aQ8CFW7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,28■■■■■ 5,32
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC48,27■■■■■ 5,32
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC48,25■■■■■ 5,32
Cc2d2aQ8CFW7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC48,25■■■■■ 5,31
Cc2d2aQ8CFW7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,23■■■■■ 5,31
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,22■■■■■ 5,31
Cc2d2aQ8CFW7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC48,19■■■■■ 5,31
Cc2d2aQ8CFW7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,18■■■■■ 5,3
Cc2d2aQ8CFW7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC48,15■■■■■ 5,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,5 ms