Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hpf1Q8CFE2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hpf1Q8CFE2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hpf1Q8CFE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hpf1Q8CFE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hpf1Q8CFE2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hpf1Q8CFE2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hpf1Q8CFE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hpf1Q8CFE2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hpf1Q8CFE2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hpf1Q8CFE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hpf1Q8CFE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Hpf1Q8CFE2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Hpf1Q8CFE2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hpf1Q8CFE2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hpf1Q8CFE2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Hpf1Q8CFE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hpf1Q8CFE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hpf1Q8CFE2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Hpf1Q8CFE2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hpf1Q8CFE2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Hpf1Q8CFE2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Hpf1Q8CFE2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Hpf1Q8CFE2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Hpf1Q8CFE2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Hpf1Q8CFE2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Hpf1Q8CFE2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Hpf1Q8CFE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Hpf1Q8CFE2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Hpf1Q8CFE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Hpf1Q8CFE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Hpf1Q8CFE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Hpf1Q8CFE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Hpf1Q8CFE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Hpf1Q8CFE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Hpf1Q8CFE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Hpf1Q8CFE2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Hpf1Q8CFE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Hpf1Q8CFE2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Hpf1Q8CFE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Hpf1Q8CFE2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Hpf1Q8CFE2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Hpf1Q8CFE2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Hpf1Q8CFE2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Hpf1Q8CFE2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Hpf1Q8CFE2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Hpf1Q8CFE2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Hpf1Q8CFE2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Hpf1Q8CFE2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Hpf1Q8CFE2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Hpf1Q8CFE2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Hpf1Q8CFE2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Hpf1Q8CFE2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Hpf1Q8CFE2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Hpf1Q8CFE2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Hpf1Q8CFE2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Hpf1Q8CFE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Hpf1Q8CFE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Hpf1Q8CFE2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Hpf1Q8CFE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Hpf1Q8CFE2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Hpf1Q8CFE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Hpf1Q8CFE2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Hpf1Q8CFE2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Hpf1Q8CFE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Hpf1Q8CFE2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Hpf1Q8CFE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Hpf1Q8CFE2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Hpf1Q8CFE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Hpf1Q8CFE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Hpf1Q8CFE2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Hpf1Q8CFE2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Hpf1Q8CFE2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Hpf1Q8CFE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Hpf1Q8CFE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Hpf1Q8CFE2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
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