Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rassf4Q8CB96 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rassf4Q8CB96 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Rassf4Q8CB96 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rassf4Q8CB96 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rassf4Q8CB96 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rassf4Q8CB96 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rassf4Q8CB96 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rassf4Q8CB96 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rassf4Q8CB96 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Rassf4Q8CB96 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rassf4Q8CB96 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rassf4Q8CB96 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rassf4Q8CB96 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Rassf4Q8CB96 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rassf4Q8CB96 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rassf4Q8CB96 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rassf4Q8CB96 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rassf4Q8CB96 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rassf4Q8CB96 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rassf4Q8CB96 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rassf4Q8CB96 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rassf4Q8CB96 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rassf4Q8CB96 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rassf4Q8CB96 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rassf4Q8CB96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rassf4Q8CB96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Rassf4Q8CB96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Rassf4Q8CB96 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rassf4Q8CB96 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rassf4Q8CB96 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Rassf4Q8CB96 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Rassf4Q8CB96 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,2■■■□□ 2,11
Rassf4Q8CB96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Rassf4Q8CB96 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rassf4Q8CB96 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Rassf4Q8CB96 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rassf4Q8CB96 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Rassf4Q8CB96 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rassf4Q8CB96 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Rassf4Q8CB96 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Rassf4Q8CB96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rassf4Q8CB96 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rassf4Q8CB96 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Rassf4Q8CB96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rassf4Q8CB96 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Rassf4Q8CB96 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rassf4Q8CB96 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rassf4Q8CB96 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rassf4Q8CB96 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Rassf4Q8CB96 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Rassf4Q8CB96 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rassf4Q8CB96 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Rassf4Q8CB96 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rassf4Q8CB96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rassf4Q8CB96 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rassf4Q8CB96 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rassf4Q8CB96 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rassf4Q8CB96 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rassf4Q8CB96 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rassf4Q8CB96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Rassf4Q8CB96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Rassf4Q8CB96 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rassf4Q8CB96 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Rassf4Q8CB96 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rassf4Q8CB96 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rassf4Q8CB96 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Rassf4Q8CB96 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Rassf4Q8CB96 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rassf4Q8CB96 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rassf4Q8CB96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rassf4Q8CB96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rassf4Q8CB96 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rassf4Q8CB96 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rassf4Q8CB96 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rassf4Q8CB96 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rassf4Q8CB96 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rassf4Q8CB96 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,4 ms