Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc159Q8C963 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ccdc159Q8C963 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ccdc159Q8C963 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc159Q8C963 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ccdc159Q8C963 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ccdc159Q8C963 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ccdc159Q8C963 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc159Q8C963 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ccdc159Q8C963 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ccdc159Q8C963 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc159Q8C963 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ccdc159Q8C963 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ccdc159Q8C963 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ccdc159Q8C963 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Ccdc159Q8C963 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc159Q8C963 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ccdc159Q8C963 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ccdc159Q8C963 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc159Q8C963 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc159Q8C963 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc159Q8C963 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ccdc159Q8C963 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ccdc159Q8C963 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ccdc159Q8C963 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ccdc159Q8C963 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ccdc159Q8C963 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc159Q8C963 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc159Q8C963 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc159Q8C963 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ccdc159Q8C963 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc159Q8C963 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc159Q8C963 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc159Q8C963 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc159Q8C963 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc159Q8C963 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc159Q8C963 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc159Q8C963 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc159Q8C963 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc159Q8C963 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ccdc159Q8C963 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ccdc159Q8C963 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc159Q8C963 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ccdc159Q8C963 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ccdc159Q8C963 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc159Q8C963 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ccdc159Q8C963 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ccdc159Q8C963 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc159Q8C963 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ccdc159Q8C963 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc159Q8C963 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ccdc159Q8C963 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc159Q8C963 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc159Q8C963 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc159Q8C963 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc159Q8C963 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc159Q8C963 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc159Q8C963 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc159Q8C963 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc159Q8C963 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc159Q8C963 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc159Q8C963 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc159Q8C963 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ccdc159Q8C963 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ccdc159Q8C963 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ccdc159Q8C963 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccdc159Q8C963 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc159Q8C963 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ccdc159Q8C963 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ccdc159Q8C963 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc159Q8C963 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc159Q8C963 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Ccdc159Q8C963 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc159Q8C963 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc159Q8C963 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ccdc159Q8C963 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc159Q8C963 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc159Q8C963 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc159Q8C963 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc159Q8C963 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms