Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssxb2Q8C5Z3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssxb2Q8C5Z3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssxb2Q8C5Z3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssxb2Q8C5Z3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb2Q8C5Z3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssxb2Q8C5Z3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb2Q8C5Z3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb2Q8C5Z3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb2Q8C5Z3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb2Q8C5Z3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb2Q8C5Z3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb2Q8C5Z3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb2Q8C5Z3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb2Q8C5Z3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb2Q8C5Z3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssxb2Q8C5Z3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb2Q8C5Z3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb2Q8C5Z3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssxb2Q8C5Z3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssxb2Q8C5Z3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssxb2Q8C5Z3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssxb2Q8C5Z3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssxb2Q8C5Z3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssxb2Q8C5Z3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb2Q8C5Z3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb2Q8C5Z3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb2Q8C5Z3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb2Q8C5Z3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb2Q8C5Z3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb2Q8C5Z3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb2Q8C5Z3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb2Q8C5Z3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb2Q8C5Z3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb2Q8C5Z3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb2Q8C5Z3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssxb2Q8C5Z3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb2Q8C5Z3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssxb2Q8C5Z3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssxb2Q8C5Z3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssxb2Q8C5Z3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxb2Q8C5Z3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssxb2Q8C5Z3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb2Q8C5Z3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb2Q8C5Z3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb2Q8C5Z3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb2Q8C5Z3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb2Q8C5Z3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb2Q8C5Z3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb2Q8C5Z3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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