Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pggt1bQ8BUY9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pggt1bQ8BUY9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pggt1bQ8BUY9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pggt1bQ8BUY9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pggt1bQ8BUY9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pggt1bQ8BUY9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pggt1bQ8BUY9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pggt1bQ8BUY9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pggt1bQ8BUY9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pggt1bQ8BUY9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pggt1bQ8BUY9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pggt1bQ8BUY9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pggt1bQ8BUY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pggt1bQ8BUY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pggt1bQ8BUY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pggt1bQ8BUY9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pggt1bQ8BUY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pggt1bQ8BUY9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pggt1bQ8BUY9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pggt1bQ8BUY9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pggt1bQ8BUY9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pggt1bQ8BUY9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pggt1bQ8BUY9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pggt1bQ8BUY9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pggt1bQ8BUY9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pggt1bQ8BUY9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pggt1bQ8BUY9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pggt1bQ8BUY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pggt1bQ8BUY9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pggt1bQ8BUY9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pggt1bQ8BUY9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pggt1bQ8BUY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pggt1bQ8BUY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pggt1bQ8BUY9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pggt1bQ8BUY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pggt1bQ8BUY9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pggt1bQ8BUY9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pggt1bQ8BUY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pggt1bQ8BUY9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pggt1bQ8BUY9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pggt1bQ8BUY9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pggt1bQ8BUY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pggt1bQ8BUY9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pggt1bQ8BUY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pggt1bQ8BUY9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pggt1bQ8BUY9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pggt1bQ8BUY9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pggt1bQ8BUY9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pggt1bQ8BUY9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pggt1bQ8BUY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pggt1bQ8BUY9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pggt1bQ8BUY9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pggt1bQ8BUY9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pggt1bQ8BUY9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pggt1bQ8BUY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pggt1bQ8BUY9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pggt1bQ8BUY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pggt1bQ8BUY9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pggt1bQ8BUY9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pggt1bQ8BUY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pggt1bQ8BUY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pggt1bQ8BUY9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pggt1bQ8BUY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pggt1bQ8BUY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pggt1bQ8BUY9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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