Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
E330017A01RikQ8BU47 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E330017A01RikQ8BU47 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E330017A01RikQ8BU47 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E330017A01RikQ8BU47 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E330017A01RikQ8BU47 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E330017A01RikQ8BU47 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E330017A01RikQ8BU47 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E330017A01RikQ8BU47 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
E330017A01RikQ8BU47 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
E330017A01RikQ8BU47 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E330017A01RikQ8BU47 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E330017A01RikQ8BU47 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
E330017A01RikQ8BU47 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
E330017A01RikQ8BU47 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E330017A01RikQ8BU47 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E330017A01RikQ8BU47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E330017A01RikQ8BU47 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E330017A01RikQ8BU47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E330017A01RikQ8BU47 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E330017A01RikQ8BU47 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E330017A01RikQ8BU47 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E330017A01RikQ8BU47 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
E330017A01RikQ8BU47 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.55■■■□□ 2
E330017A01RikQ8BU47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E330017A01RikQ8BU47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E330017A01RikQ8BU47 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
E330017A01RikQ8BU47 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E330017A01RikQ8BU47 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E330017A01RikQ8BU47 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E330017A01RikQ8BU47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E330017A01RikQ8BU47 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E330017A01RikQ8BU47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E330017A01RikQ8BU47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
E330017A01RikQ8BU47 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E330017A01RikQ8BU47 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E330017A01RikQ8BU47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E330017A01RikQ8BU47 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E330017A01RikQ8BU47 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E330017A01RikQ8BU47 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E330017A01RikQ8BU47 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E330017A01RikQ8BU47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E330017A01RikQ8BU47 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E330017A01RikQ8BU47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E330017A01RikQ8BU47 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
E330017A01RikQ8BU47 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
E330017A01RikQ8BU47 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
E330017A01RikQ8BU47 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E330017A01RikQ8BU47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E330017A01RikQ8BU47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
E330017A01RikQ8BU47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E330017A01RikQ8BU47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E330017A01RikQ8BU47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E330017A01RikQ8BU47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E330017A01RikQ8BU47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E330017A01RikQ8BU47 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E330017A01RikQ8BU47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E330017A01RikQ8BU47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E330017A01RikQ8BU47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E330017A01RikQ8BU47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E330017A01RikQ8BU47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E330017A01RikQ8BU47 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E330017A01RikQ8BU47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E330017A01RikQ8BU47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E330017A01RikQ8BU47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
E330017A01RikQ8BU47 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E330017A01RikQ8BU47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E330017A01RikQ8BU47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E330017A01RikQ8BU47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E330017A01RikQ8BU47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E330017A01RikQ8BU47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E330017A01RikQ8BU47 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E330017A01RikQ8BU47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E330017A01RikQ8BU47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E330017A01RikQ8BU47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E330017A01RikQ8BU47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E330017A01RikQ8BU47 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E330017A01RikQ8BU47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E330017A01RikQ8BU47 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E330017A01RikQ8BU47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E330017A01RikQ8BU47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E330017A01RikQ8BU47 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E330017A01RikQ8BU47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E330017A01RikQ8BU47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms