Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSM5

Gab3, GRB2-associated-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gab3Q8BSM5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
Gab3Q8BSM5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Gab3Q8BSM5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Gab3Q8BSM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Gab3Q8BSM5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
Gab3Q8BSM5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Gab3Q8BSM5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Gab3Q8BSM5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Gab3Q8BSM5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Gab3Q8BSM5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.87
Gab3Q8BSM5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
Gab3Q8BSM5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Gab3Q8BSM5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Gab3Q8BSM5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Gab3Q8BSM5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Gab3Q8BSM5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Gab3Q8BSM5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Gab3Q8BSM5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Gab3Q8BSM5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
Gab3Q8BSM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Gab3Q8BSM5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Gab3Q8BSM5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Gab3Q8BSM5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Gab3Q8BSM5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Gab3Q8BSM5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Gab3Q8BSM5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Gab3Q8BSM5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Gab3Q8BSM5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
Gab3Q8BSM5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Gab3Q8BSM5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
Gab3Q8BSM5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Gab3Q8BSM5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Gab3Q8BSM5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Gab3Q8BSM5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Gab3Q8BSM5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Gab3Q8BSM5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Gab3Q8BSM5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
Gab3Q8BSM5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Gab3Q8BSM5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Gab3Q8BSM5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Gab3Q8BSM5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Gab3Q8BSM5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Gab3Q8BSM5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Gab3Q8BSM5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
Gab3Q8BSM5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Gab3Q8BSM5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Gab3Q8BSM5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
Gab3Q8BSM5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
Gab3Q8BSM5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Gab3Q8BSM5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Gab3Q8BSM5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Gab3Q8BSM5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Gab3Q8BSM5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Gab3Q8BSM5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Gab3Q8BSM5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Gab3Q8BSM5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Gab3Q8BSM5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Gab3Q8BSM5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Gab3Q8BSM5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
Gab3Q8BSM5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Gab3Q8BSM5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Gab3Q8BSM5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Gab3Q8BSM5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Gab3Q8BSM5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Gab3Q8BSM5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Gab3Q8BSM5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Gab3Q8BSM5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Gab3Q8BSM5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Gab3Q8BSM5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
Gab3Q8BSM5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Gab3Q8BSM5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Gab3Q8BSM5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Gab3Q8BSM5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Gab3Q8BSM5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Gab3Q8BSM5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Gab3Q8BSM5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Gab3Q8BSM5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Gab3Q8BSM5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Gab3Q8BSM5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Gab3Q8BSM5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Gab3Q8BSM5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Gab3Q8BSM5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Gab3Q8BSM5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
Gab3Q8BSM5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Gab3Q8BSM5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Gab3Q8BSM5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Gab3Q8BSM5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Gab3Q8BSM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Gab3Q8BSM5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Gab3Q8BSM5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Gab3Q8BSM5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Gab3Q8BSM5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Gab3Q8BSM5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Gab3Q8BSM5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Gab3Q8BSM5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Gab3Q8BSM5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Gab3Q8BSM5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Gab3Q8BSM5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Gab3Q8BSM5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
Gab3Q8BSM5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms