Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Bicd1Q8BR07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Bicd1Q8BR07 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Bicd1Q8BR07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Bicd1Q8BR07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Bicd1Q8BR07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Bicd1Q8BR07 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Bicd1Q8BR07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Bicd1Q8BR07 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Bicd1Q8BR07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Bicd1Q8BR07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Bicd1Q8BR07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Bicd1Q8BR07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Bicd1Q8BR07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Bicd1Q8BR07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Bicd1Q8BR07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Bicd1Q8BR07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Bicd1Q8BR07 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Bicd1Q8BR07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Bicd1Q8BR07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Bicd1Q8BR07 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Bicd1Q8BR07 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Bicd1Q8BR07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Bicd1Q8BR07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Bicd1Q8BR07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Bicd1Q8BR07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Bicd1Q8BR07 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Bicd1Q8BR07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Bicd1Q8BR07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Bicd1Q8BR07 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Bicd1Q8BR07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Bicd1Q8BR07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Bicd1Q8BR07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Bicd1Q8BR07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Bicd1Q8BR07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Bicd1Q8BR07 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Bicd1Q8BR07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Bicd1Q8BR07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Bicd1Q8BR07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Bicd1Q8BR07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Bicd1Q8BR07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Bicd1Q8BR07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Bicd1Q8BR07 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Bicd1Q8BR07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Bicd1Q8BR07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Bicd1Q8BR07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Bicd1Q8BR07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Bicd1Q8BR07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Bicd1Q8BR07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Bicd1Q8BR07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Bicd1Q8BR07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Bicd1Q8BR07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Bicd1Q8BR07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Bicd1Q8BR07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Bicd1Q8BR07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Bicd1Q8BR07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Bicd1Q8BR07 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Bicd1Q8BR07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Bicd1Q8BR07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Bicd1Q8BR07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Bicd1Q8BR07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Bicd1Q8BR07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Bicd1Q8BR07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Bicd1Q8BR07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Bicd1Q8BR07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Bicd1Q8BR07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Bicd1Q8BR07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Bicd1Q8BR07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Bicd1Q8BR07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Bicd1Q8BR07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Bicd1Q8BR07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Bicd1Q8BR07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Bicd1Q8BR07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms