Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bicd1Q8BR07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bicd1Q8BR07 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bicd1Q8BR07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bicd1Q8BR07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bicd1Q8BR07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bicd1Q8BR07 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Bicd1Q8BR07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bicd1Q8BR07 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bicd1Q8BR07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bicd1Q8BR07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bicd1Q8BR07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bicd1Q8BR07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bicd1Q8BR07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bicd1Q8BR07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bicd1Q8BR07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Bicd1Q8BR07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bicd1Q8BR07 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bicd1Q8BR07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bicd1Q8BR07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bicd1Q8BR07 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bicd1Q8BR07 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bicd1Q8BR07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bicd1Q8BR07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bicd1Q8BR07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bicd1Q8BR07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bicd1Q8BR07 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bicd1Q8BR07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bicd1Q8BR07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bicd1Q8BR07 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bicd1Q8BR07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bicd1Q8BR07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bicd1Q8BR07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bicd1Q8BR07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Bicd1Q8BR07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bicd1Q8BR07 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bicd1Q8BR07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bicd1Q8BR07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bicd1Q8BR07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bicd1Q8BR07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bicd1Q8BR07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bicd1Q8BR07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bicd1Q8BR07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bicd1Q8BR07 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bicd1Q8BR07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Bicd1Q8BR07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bicd1Q8BR07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bicd1Q8BR07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bicd1Q8BR07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bicd1Q8BR07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bicd1Q8BR07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bicd1Q8BR07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bicd1Q8BR07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bicd1Q8BR07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bicd1Q8BR07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bicd1Q8BR07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bicd1Q8BR07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bicd1Q8BR07 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bicd1Q8BR07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bicd1Q8BR07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bicd1Q8BR07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bicd1Q8BR07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bicd1Q8BR07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bicd1Q8BR07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bicd1Q8BR07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bicd1Q8BR07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bicd1Q8BR07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bicd1Q8BR07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bicd1Q8BR07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bicd1Q8BR07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bicd1Q8BR07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bicd1Q8BR07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bicd1Q8BR07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bicd1Q8BR07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms