Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Sfr1Q8BP27 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Sfr1Q8BP27 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Sfr1Q8BP27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Sfr1Q8BP27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Sfr1Q8BP27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sfr1Q8BP27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sfr1Q8BP27 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Sfr1Q8BP27 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Sfr1Q8BP27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Sfr1Q8BP27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Sfr1Q8BP27 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Sfr1Q8BP27 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Sfr1Q8BP27 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Sfr1Q8BP27 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Sfr1Q8BP27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Sfr1Q8BP27 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Sfr1Q8BP27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Sfr1Q8BP27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Sfr1Q8BP27 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Sfr1Q8BP27 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Sfr1Q8BP27 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Sfr1Q8BP27 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Sfr1Q8BP27 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Sfr1Q8BP27 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Sfr1Q8BP27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Sfr1Q8BP27 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Sfr1Q8BP27 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Sfr1Q8BP27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Sfr1Q8BP27 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Sfr1Q8BP27 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Sfr1Q8BP27 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Sfr1Q8BP27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Sfr1Q8BP27 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Sfr1Q8BP27 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Sfr1Q8BP27 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Sfr1Q8BP27 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Sfr1Q8BP27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Sfr1Q8BP27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Sfr1Q8BP27 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Sfr1Q8BP27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sfr1Q8BP27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sfr1Q8BP27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Sfr1Q8BP27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sfr1Q8BP27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sfr1Q8BP27 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sfr1Q8BP27 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sfr1Q8BP27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Sfr1Q8BP27 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Sfr1Q8BP27 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Sfr1Q8BP27 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Sfr1Q8BP27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Sfr1Q8BP27 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Sfr1Q8BP27 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Sfr1Q8BP27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Sfr1Q8BP27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Sfr1Q8BP27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Sfr1Q8BP27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Sfr1Q8BP27 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Sfr1Q8BP27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Sfr1Q8BP27 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Sfr1Q8BP27 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Sfr1Q8BP27 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Sfr1Q8BP27 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Sfr1Q8BP27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Sfr1Q8BP27 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Sfr1Q8BP27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Sfr1Q8BP27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Sfr1Q8BP27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Sfr1Q8BP27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Sfr1Q8BP27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Sfr1Q8BP27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Sfr1Q8BP27 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Sfr1Q8BP27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Sfr1Q8BP27 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Sfr1Q8BP27 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Sfr1Q8BP27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Sfr1Q8BP27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Sfr1Q8BP27 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Sfr1Q8BP27 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Sfr1Q8BP27 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49,1 ms