Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Tcaf1Q8BNE1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Tcaf1Q8BNE1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Tcaf1Q8BNE1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,45
Tcaf1Q8BNE1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Tcaf1Q8BNE1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Tcaf1Q8BNE1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Tcaf1Q8BNE1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Tcaf1Q8BNE1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Tcaf1Q8BNE1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Tcaf1Q8BNE1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Tcaf1Q8BNE1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Tcaf1Q8BNE1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tcaf1Q8BNE1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tcaf1Q8BNE1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Tcaf1Q8BNE1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Tcaf1Q8BNE1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Tcaf1Q8BNE1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tcaf1Q8BNE1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tcaf1Q8BNE1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Tcaf1Q8BNE1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Tcaf1Q8BNE1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Tcaf1Q8BNE1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Tcaf1Q8BNE1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Tcaf1Q8BNE1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Tcaf1Q8BNE1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Tcaf1Q8BNE1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Tcaf1Q8BNE1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tcaf1Q8BNE1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Tcaf1Q8BNE1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tcaf1Q8BNE1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tcaf1Q8BNE1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Tcaf1Q8BNE1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Tcaf1Q8BNE1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tcaf1Q8BNE1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tcaf1Q8BNE1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Tcaf1Q8BNE1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Tcaf1Q8BNE1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Tcaf1Q8BNE1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tcaf1Q8BNE1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tcaf1Q8BNE1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tcaf1Q8BNE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Tcaf1Q8BNE1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tcaf1Q8BNE1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tcaf1Q8BNE1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Tcaf1Q8BNE1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Tcaf1Q8BNE1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tcaf1Q8BNE1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tcaf1Q8BNE1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tcaf1Q8BNE1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tcaf1Q8BNE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tcaf1Q8BNE1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tcaf1Q8BNE1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tcaf1Q8BNE1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tcaf1Q8BNE1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tcaf1Q8BNE1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Tcaf1Q8BNE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Tcaf1Q8BNE1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Tcaf1Q8BNE1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tcaf1Q8BNE1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tcaf1Q8BNE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tcaf1Q8BNE1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tcaf1Q8BNE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tcaf1Q8BNE1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Tcaf1Q8BNE1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Tcaf1Q8BNE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tcaf1Q8BNE1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tcaf1Q8BNE1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Tcaf1Q8BNE1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Tcaf1Q8BNE1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tcaf1Q8BNE1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tcaf1Q8BNE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Tcaf1Q8BNE1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tcaf1Q8BNE1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tcaf1Q8BNE1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tcaf1Q8BNE1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Tcaf1Q8BNE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Tcaf1Q8BNE1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tcaf1Q8BNE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tcaf1Q8BNE1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Tcaf1Q8BNE1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Tcaf1Q8BNE1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Tcaf1Q8BNE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tcaf1Q8BNE1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tcaf1Q8BNE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Tcaf1Q8BNE1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tcaf1Q8BNE1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tcaf1Q8BNE1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tcaf1Q8BNE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tcaf1Q8BNE1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tcaf1Q8BNE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tcaf1Q8BNE1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
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