Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prox2Q8BII1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prox2Q8BII1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prox2Q8BII1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prox2Q8BII1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Prox2Q8BII1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prox2Q8BII1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prox2Q8BII1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prox2Q8BII1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prox2Q8BII1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prox2Q8BII1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prox2Q8BII1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prox2Q8BII1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prox2Q8BII1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prox2Q8BII1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prox2Q8BII1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prox2Q8BII1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prox2Q8BII1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prox2Q8BII1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prox2Q8BII1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Prox2Q8BII1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prox2Q8BII1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prox2Q8BII1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prox2Q8BII1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prox2Q8BII1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prox2Q8BII1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prox2Q8BII1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prox2Q8BII1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prox2Q8BII1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prox2Q8BII1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prox2Q8BII1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prox2Q8BII1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prox2Q8BII1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prox2Q8BII1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prox2Q8BII1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prox2Q8BII1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prox2Q8BII1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prox2Q8BII1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prox2Q8BII1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prox2Q8BII1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prox2Q8BII1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prox2Q8BII1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prox2Q8BII1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prox2Q8BII1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prox2Q8BII1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prox2Q8BII1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prox2Q8BII1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prox2Q8BII1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prox2Q8BII1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prox2Q8BII1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prox2Q8BII1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prox2Q8BII1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prox2Q8BII1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prox2Q8BII1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prox2Q8BII1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prox2Q8BII1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prox2Q8BII1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prox2Q8BII1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prox2Q8BII1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prox2Q8BII1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prox2Q8BII1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prox2Q8BII1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prox2Q8BII1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prox2Q8BII1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prox2Q8BII1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prox2Q8BII1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prox2Q8BII1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prox2Q8BII1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prox2Q8BII1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Prox2Q8BII1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prox2Q8BII1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prox2Q8BII1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prox2Q8BII1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prox2Q8BII1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prox2Q8BII1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prox2Q8BII1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prox2Q8BII1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prox2Q8BII1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prox2Q8BII1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prox2Q8BII1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prox2Q8BII1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prox2Q8BII1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prox2Q8BII1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prox2Q8BII1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prox2Q8BII1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms