Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD8

Coa6, Cytochrome c oxidase assembly factor 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa6Q8BGD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa6Q8BGD8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa6Q8BGD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa6Q8BGD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Coa6Q8BGD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Coa6Q8BGD8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Coa6Q8BGD8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Coa6Q8BGD8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Coa6Q8BGD8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Coa6Q8BGD8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Coa6Q8BGD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Coa6Q8BGD8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Coa6Q8BGD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Coa6Q8BGD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Coa6Q8BGD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Coa6Q8BGD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Coa6Q8BGD8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Coa6Q8BGD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Coa6Q8BGD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Coa6Q8BGD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Coa6Q8BGD8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Coa6Q8BGD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa6Q8BGD8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Coa6Q8BGD8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa6Q8BGD8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Coa6Q8BGD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Coa6Q8BGD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms