Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrl2Q8BG73 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrl2Q8BG73 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrl2Q8BG73 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrl2Q8BG73 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrl2Q8BG73 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrl2Q8BG73 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrl2Q8BG73 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrl2Q8BG73 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrl2Q8BG73 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrl2Q8BG73 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrl2Q8BG73 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrl2Q8BG73 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrl2Q8BG73 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bgrl2Q8BG73 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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