Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG16

Slc6a15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a15Q8BG16 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc6a15Q8BG16 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc6a15Q8BG16 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc6a15Q8BG16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc6a15Q8BG16 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc6a15Q8BG16 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc6a15Q8BG16 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc6a15Q8BG16 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a15Q8BG16 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a15Q8BG16 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc6a15Q8BG16 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc6a15Q8BG16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc6a15Q8BG16 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc6a15Q8BG16 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a15Q8BG16 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc6a15Q8BG16 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc6a15Q8BG16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a15Q8BG16 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a15Q8BG16 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc6a15Q8BG16 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc6a15Q8BG16 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc6a15Q8BG16 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a15Q8BG16 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a15Q8BG16 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a15Q8BG16 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc6a15Q8BG16 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc6a15Q8BG16 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a15Q8BG16 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a15Q8BG16 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc6a15Q8BG16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc6a15Q8BG16 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc6a15Q8BG16 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc6a15Q8BG16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a15Q8BG16 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a15Q8BG16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc6a15Q8BG16 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc6a15Q8BG16 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc6a15Q8BG16 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc6a15Q8BG16 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc6a15Q8BG16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a15Q8BG16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc6a15Q8BG16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc6a15Q8BG16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc6a15Q8BG16 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc6a15Q8BG16 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc6a15Q8BG16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc6a15Q8BG16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc6a15Q8BG16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc6a15Q8BG16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc6a15Q8BG16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc6a15Q8BG16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc6a15Q8BG16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc6a15Q8BG16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc6a15Q8BG16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc6a15Q8BG16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc6a15Q8BG16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc6a15Q8BG16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc6a15Q8BG16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a15Q8BG16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc6a15Q8BG16 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a15Q8BG16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a15Q8BG16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a15Q8BG16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a15Q8BG16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a15Q8BG16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc6a15Q8BG16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc6a15Q8BG16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a15Q8BG16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a15Q8BG16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a15Q8BG16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a15Q8BG16 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a15Q8BG16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a15Q8BG16 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a15Q8BG16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a15Q8BG16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms