Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Jmjd4Q8BFT6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Jmjd4Q8BFT6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Jmjd4Q8BFT6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Jmjd4Q8BFT6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Jmjd4Q8BFT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Jmjd4Q8BFT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Jmjd4Q8BFT6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Jmjd4Q8BFT6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Jmjd4Q8BFT6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Jmjd4Q8BFT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Jmjd4Q8BFT6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Jmjd4Q8BFT6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Jmjd4Q8BFT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Jmjd4Q8BFT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Jmjd4Q8BFT6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Jmjd4Q8BFT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Jmjd4Q8BFT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Jmjd4Q8BFT6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Jmjd4Q8BFT6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Jmjd4Q8BFT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Jmjd4Q8BFT6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Jmjd4Q8BFT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Jmjd4Q8BFT6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Jmjd4Q8BFT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Jmjd4Q8BFT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Jmjd4Q8BFT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Jmjd4Q8BFT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Jmjd4Q8BFT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Jmjd4Q8BFT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Jmjd4Q8BFT6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Jmjd4Q8BFT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Jmjd4Q8BFT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Jmjd4Q8BFT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jmjd4Q8BFT6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Jmjd4Q8BFT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Jmjd4Q8BFT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Jmjd4Q8BFT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Jmjd4Q8BFT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Jmjd4Q8BFT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Jmjd4Q8BFT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Jmjd4Q8BFT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Jmjd4Q8BFT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Jmjd4Q8BFT6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Jmjd4Q8BFT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Jmjd4Q8BFT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Jmjd4Q8BFT6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Jmjd4Q8BFT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Jmjd4Q8BFT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Jmjd4Q8BFT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Jmjd4Q8BFT6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Jmjd4Q8BFT6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Jmjd4Q8BFT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Jmjd4Q8BFT6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Jmjd4Q8BFT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Jmjd4Q8BFT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Jmjd4Q8BFT6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Jmjd4Q8BFT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Jmjd4Q8BFT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Jmjd4Q8BFT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Jmjd4Q8BFT6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Jmjd4Q8BFT6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Jmjd4Q8BFT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Jmjd4Q8BFT6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Jmjd4Q8BFT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Jmjd4Q8BFT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Jmjd4Q8BFT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Jmjd4Q8BFT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Jmjd4Q8BFT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Jmjd4Q8BFT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Jmjd4Q8BFT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Jmjd4Q8BFT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms