Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Srrm3Q80WV7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Srrm3Q80WV7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Srrm3Q80WV7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srrm3Q80WV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srrm3Q80WV7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srrm3Q80WV7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srrm3Q80WV7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srrm3Q80WV7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Srrm3Q80WV7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Srrm3Q80WV7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Srrm3Q80WV7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Srrm3Q80WV7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Srrm3Q80WV7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Srrm3Q80WV7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Srrm3Q80WV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Srrm3Q80WV7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Srrm3Q80WV7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srrm3Q80WV7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srrm3Q80WV7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srrm3Q80WV7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srrm3Q80WV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srrm3Q80WV7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Srrm3Q80WV7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Srrm3Q80WV7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srrm3Q80WV7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srrm3Q80WV7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srrm3Q80WV7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srrm3Q80WV7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srrm3Q80WV7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srrm3Q80WV7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Srrm3Q80WV7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srrm3Q80WV7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srrm3Q80WV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srrm3Q80WV7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Srrm3Q80WV7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Srrm3Q80WV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srrm3Q80WV7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srrm3Q80WV7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srrm3Q80WV7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Srrm3Q80WV7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srrm3Q80WV7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srrm3Q80WV7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srrm3Q80WV7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Srrm3Q80WV7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srrm3Q80WV7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srrm3Q80WV7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srrm3Q80WV7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Srrm3Q80WV7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Srrm3Q80WV7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Srrm3Q80WV7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Srrm3Q80WV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srrm3Q80WV7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srrm3Q80WV7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srrm3Q80WV7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srrm3Q80WV7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srrm3Q80WV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srrm3Q80WV7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm3Q80WV7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm3Q80WV7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Srrm3Q80WV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Srrm3Q80WV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srrm3Q80WV7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Srrm3Q80WV7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srrm3Q80WV7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srrm3Q80WV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Srrm3Q80WV7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srrm3Q80WV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srrm3Q80WV7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srrm3Q80WV7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srrm3Q80WV7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srrm3Q80WV7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms