Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcsk9Q80W65 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcsk9Q80W65 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcsk9Q80W65 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcsk9Q80W65 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcsk9Q80W65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcsk9Q80W65 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcsk9Q80W65 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcsk9Q80W65 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcsk9Q80W65 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcsk9Q80W65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcsk9Q80W65 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcsk9Q80W65 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcsk9Q80W65 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcsk9Q80W65 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcsk9Q80W65 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcsk9Q80W65 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcsk9Q80W65 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcsk9Q80W65 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcsk9Q80W65 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcsk9Q80W65 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcsk9Q80W65 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcsk9Q80W65 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcsk9Q80W65 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcsk9Q80W65 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcsk9Q80W65 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcsk9Q80W65 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcsk9Q80W65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcsk9Q80W65 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcsk9Q80W65 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcsk9Q80W65 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcsk9Q80W65 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcsk9Q80W65 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcsk9Q80W65 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcsk9Q80W65 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcsk9Q80W65 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcsk9Q80W65 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcsk9Q80W65 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcsk9Q80W65 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcsk9Q80W65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcsk9Q80W65 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcsk9Q80W65 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcsk9Q80W65 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcsk9Q80W65 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcsk9Q80W65 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcsk9Q80W65 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcsk9Q80W65 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcsk9Q80W65 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcsk9Q80W65 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcsk9Q80W65 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcsk9Q80W65 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcsk9Q80W65 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcsk9Q80W65 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcsk9Q80W65 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcsk9Q80W65 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcsk9Q80W65 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcsk9Q80W65 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcsk9Q80W65 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcsk9Q80W65 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcsk9Q80W65 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcsk9Q80W65 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcsk9Q80W65 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcsk9Q80W65 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcsk9Q80W65 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcsk9Q80W65 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcsk9Q80W65 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcsk9Q80W65 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcsk9Q80W65 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcsk9Q80W65 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcsk9Q80W65 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcsk9Q80W65 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcsk9Q80W65 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcsk9Q80W65 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcsk9Q80W65 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcsk9Q80W65 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcsk9Q80W65 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcsk9Q80W65 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcsk9Q80W65 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcsk9Q80W65 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcsk9Q80W65 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcsk9Q80W65 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcsk9Q80W65 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcsk9Q80W65 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcsk9Q80W65 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcsk9Q80W65 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcsk9Q80W65 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcsk9Q80W65 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcsk9Q80W65 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms