Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45,5■■■■■ 4,87
AknaQ80VW7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45,4■■■■■ 4,86
AknaQ80VW7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45,35■■■■■ 4,85
AknaQ80VW7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45,27■■■■■ 4,84
AknaQ80VW7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,26■■■■■ 4,84
AknaQ80VW7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,23■■■■■ 4,83
AknaQ80VW7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45,22■■■■■ 4,83
AknaQ80VW7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC45,18■■■■■ 4,82
AknaQ80VW7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,16■■■■■ 4,82
AknaQ80VW7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,14■■■■■ 4,82
AknaQ80VW7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC45,09■■■■■ 4,81
AknaQ80VW7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,05■■■■■ 4,8
AknaQ80VW7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45,04■■■■■ 4,8
AknaQ80VW7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,95■■■■■ 4,79
AknaQ80VW7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,94■■■■■ 4,79
AknaQ80VW7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44,84■■■■■ 4,77
AknaQ80VW7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC44,84■■■■■ 4,77
AknaQ80VW7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44,82■■■■■ 4,77
AknaQ80VW7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,8■■■■■ 4,76
AknaQ80VW7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,76■■■■■ 4,76
AknaQ80VW7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44,71■■■■■ 4,75
AknaQ80VW7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44,71■■■■■ 4,75
AknaQ80VW7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44,64■■■■■ 4,74
AknaQ80VW7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,64■■■■■ 4,74
AknaQ80VW7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,62■■■■■ 4,73
AknaQ80VW7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,59■■■■■ 4,73
AknaQ80VW7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44,58■■■■■ 4,73
AknaQ80VW7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,57■■■■■ 4,73
AknaQ80VW7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44,57■■■■■ 4,72
AknaQ80VW7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44,55■■■■■ 4,72
AknaQ80VW7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,46■■■■■ 4,71
AknaQ80VW7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44,44■■■■■ 4,7
AknaQ80VW7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,42■■■■■ 4,7
AknaQ80VW7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC44,37■■■■■ 4,69
AknaQ80VW7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,31■■■■■ 4,68
AknaQ80VW7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,29■■■■■ 4,68
AknaQ80VW7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,28■■■■■ 4,68
AknaQ80VW7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,24■■■■■ 4,67
AknaQ80VW7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44,24■■■■■ 4,67
AknaQ80VW7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44,24■■■■■ 4,67
AknaQ80VW7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC44,16■■■■■ 4,66
AknaQ80VW7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
AknaQ80VW7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,65
AknaQ80VW7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
AknaQ80VW7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC44,1■■■■■ 4,65
AknaQ80VW7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43,99■■■■■ 4,63
AknaQ80VW7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43,96■■■■■ 4,63
AknaQ80VW7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43,94■■■■■ 4,62
AknaQ80VW7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,93■■■■■ 4,62
AknaQ80VW7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43,91■■■■■ 4,62
AknaQ80VW7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43,9■■■■■ 4,62
AknaQ80VW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,61
AknaQ80VW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43,86■■■■■ 4,61
AknaQ80VW7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43,86■■■■■ 4,61
AknaQ80VW7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,86■■■■■ 4,61
AknaQ80VW7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,82■■■■■ 4,61
AknaQ80VW7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
AknaQ80VW7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43,75■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43,75■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,74■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43,73■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43,7■■■■■ 4,59
AknaQ80VW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43,69■■■■■ 4,58
AknaQ80VW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,69■■■■■ 4,58
AknaQ80VW7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
AknaQ80VW7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
AknaQ80VW7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
AknaQ80VW7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,59■■■■■ 4,57
AknaQ80VW7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,59■■■■■ 4,57
AknaQ80VW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
AknaQ80VW7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43,56■■■■■ 4,56
AknaQ80VW7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43,55■■■■■ 4,56
AknaQ80VW7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
AknaQ80VW7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,48■■■■■ 4,55
AknaQ80VW7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43,48■■■■■ 4,55
AknaQ80VW7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43,46■■■■■ 4,55
AknaQ80VW7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
AknaQ80VW7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
AknaQ80VW7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43,42■■■■■ 4,54
AknaQ80VW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
AknaQ80VW7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,4■■■■■ 4,54
AknaQ80VW7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
AknaQ80VW7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43,33■■■■■ 4,53
AknaQ80VW7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,53
AknaQ80VW7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43,32■■■■■ 4,52
AknaQ80VW7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,3■■■■■ 4,52
AknaQ80VW7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43,28■■■■■ 4,52
AknaQ80VW7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
AknaQ80VW7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
AknaQ80VW7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
AknaQ80VW7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
AknaQ80VW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
AknaQ80VW7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
AknaQ80VW7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43,1■■■■■ 4,49
AknaQ80VW7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
AknaQ80VW7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,09■■■■■ 4,49
AknaQ80VW7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,09■■■■■ 4,49
AknaQ80VW7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms