Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ell3Q80VR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ell3Q80VR2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ell3Q80VR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ell3Q80VR2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ell3Q80VR2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ell3Q80VR2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ell3Q80VR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ell3Q80VR2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ell3Q80VR2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ell3Q80VR2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ell3Q80VR2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ell3Q80VR2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ell3Q80VR2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell3Q80VR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell3Q80VR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell3Q80VR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell3Q80VR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell3Q80VR2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell3Q80VR2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell3Q80VR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell3Q80VR2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell3Q80VR2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ell3Q80VR2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ell3Q80VR2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ell3Q80VR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ell3Q80VR2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ell3Q80VR2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ell3Q80VR2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ell3Q80VR2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ell3Q80VR2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ell3Q80VR2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ell3Q80VR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell3Q80VR2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ell3Q80VR2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell3Q80VR2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell3Q80VR2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell3Q80VR2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell3Q80VR2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell3Q80VR2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell3Q80VR2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell3Q80VR2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell3Q80VR2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ell3Q80VR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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