Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Plxna4Q80UG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Plxna4Q80UG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Plxna4Q80UG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Plxna4Q80UG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Plxna4Q80UG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Plxna4Q80UG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Plxna4Q80UG2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Plxna4Q80UG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Plxna4Q80UG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Plxna4Q80UG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Plxna4Q80UG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,7■■■□□ 2,34
Plxna4Q80UG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Plxna4Q80UG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Plxna4Q80UG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Plxna4Q80UG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Plxna4Q80UG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Plxna4Q80UG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Plxna4Q80UG2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Plxna4Q80UG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Plxna4Q80UG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Plxna4Q80UG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Plxna4Q80UG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Plxna4Q80UG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Plxna4Q80UG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Plxna4Q80UG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Plxna4Q80UG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Plxna4Q80UG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Plxna4Q80UG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Plxna4Q80UG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Plxna4Q80UG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Plxna4Q80UG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Plxna4Q80UG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Plxna4Q80UG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Plxna4Q80UG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Plxna4Q80UG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Plxna4Q80UG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Plxna4Q80UG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Plxna4Q80UG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Plxna4Q80UG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Plxna4Q80UG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Plxna4Q80UG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Plxna4Q80UG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Plxna4Q80UG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Plxna4Q80UG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Plxna4Q80UG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Plxna4Q80UG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Plxna4Q80UG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Plxna4Q80UG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Plxna4Q80UG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Plxna4Q80UG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Plxna4Q80UG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Plxna4Q80UG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Plxna4Q80UG2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Plxna4Q80UG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Plxna4Q80UG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Plxna4Q80UG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Plxna4Q80UG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Plxna4Q80UG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Plxna4Q80UG2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Plxna4Q80UG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Plxna4Q80UG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Plxna4Q80UG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Plxna4Q80UG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Plxna4Q80UG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Plxna4Q80UG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Plxna4Q80UG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Plxna4Q80UG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Plxna4Q80UG2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Plxna4Q80UG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Plxna4Q80UG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Plxna4Q80UG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Plxna4Q80UG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Plxna4Q80UG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Plxna4Q80UG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Plxna4Q80UG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Plxna4Q80UG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Plxna4Q80UG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Plxna4Q80UG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Plxna4Q80UG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Plxna4Q80UG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Plxna4Q80UG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Plxna4Q80UG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Plxna4Q80UG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Plxna4Q80UG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Plxna4Q80UG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms