Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rexo1Q7TT28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rexo1Q7TT28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rexo1Q7TT28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rexo1Q7TT28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rexo1Q7TT28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rexo1Q7TT28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rexo1Q7TT28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rexo1Q7TT28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rexo1Q7TT28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rexo1Q7TT28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rexo1Q7TT28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rexo1Q7TT28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rexo1Q7TT28 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rexo1Q7TT28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rexo1Q7TT28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rexo1Q7TT28 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rexo1Q7TT28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rexo1Q7TT28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rexo1Q7TT28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rexo1Q7TT28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rexo1Q7TT28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rexo1Q7TT28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rexo1Q7TT28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rexo1Q7TT28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rexo1Q7TT28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rexo1Q7TT28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rexo1Q7TT28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rexo1Q7TT28 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rexo1Q7TT28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rexo1Q7TT28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rexo1Q7TT28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rexo1Q7TT28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Rexo1Q7TT28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rexo1Q7TT28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rexo1Q7TT28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rexo1Q7TT28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rexo1Q7TT28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rexo1Q7TT28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rexo1Q7TT28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rexo1Q7TT28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rexo1Q7TT28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rexo1Q7TT28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rexo1Q7TT28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rexo1Q7TT28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rexo1Q7TT28 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rexo1Q7TT28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rexo1Q7TT28 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rexo1Q7TT28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rexo1Q7TT28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rexo1Q7TT28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rexo1Q7TT28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rexo1Q7TT28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rexo1Q7TT28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rexo1Q7TT28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rexo1Q7TT28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Rexo1Q7TT28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rexo1Q7TT28 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rexo1Q7TT28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rexo1Q7TT28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rexo1Q7TT28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rexo1Q7TT28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rexo1Q7TT28 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rexo1Q7TT28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rexo1Q7TT28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rexo1Q7TT28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rexo1Q7TT28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rexo1Q7TT28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rexo1Q7TT28 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rexo1Q7TT28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rexo1Q7TT28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rexo1Q7TT28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rexo1Q7TT28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rexo1Q7TT28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rexo1Q7TT28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rexo1Q7TT28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rexo1Q7TT28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms