Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Rexo1Q7TT28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rexo1Q7TT28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Rexo1Q7TT28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Rexo1Q7TT28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Rexo1Q7TT28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Rexo1Q7TT28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rexo1Q7TT28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Rexo1Q7TT28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Rexo1Q7TT28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rexo1Q7TT28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rexo1Q7TT28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rexo1Q7TT28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rexo1Q7TT28 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Rexo1Q7TT28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Rexo1Q7TT28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Rexo1Q7TT28 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Rexo1Q7TT28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Rexo1Q7TT28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Rexo1Q7TT28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Rexo1Q7TT28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Rexo1Q7TT28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Rexo1Q7TT28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rexo1Q7TT28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rexo1Q7TT28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rexo1Q7TT28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rexo1Q7TT28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Rexo1Q7TT28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Rexo1Q7TT28 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Rexo1Q7TT28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Rexo1Q7TT28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Rexo1Q7TT28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Rexo1Q7TT28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Rexo1Q7TT28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Rexo1Q7TT28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Rexo1Q7TT28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Rexo1Q7TT28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Rexo1Q7TT28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Rexo1Q7TT28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Rexo1Q7TT28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Rexo1Q7TT28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rexo1Q7TT28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Rexo1Q7TT28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rexo1Q7TT28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rexo1Q7TT28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Rexo1Q7TT28 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rexo1Q7TT28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Rexo1Q7TT28 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rexo1Q7TT28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Rexo1Q7TT28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Rexo1Q7TT28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Rexo1Q7TT28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rexo1Q7TT28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rexo1Q7TT28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rexo1Q7TT28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rexo1Q7TT28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Rexo1Q7TT28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rexo1Q7TT28 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rexo1Q7TT28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rexo1Q7TT28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rexo1Q7TT28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rexo1Q7TT28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rexo1Q7TT28 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rexo1Q7TT28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rexo1Q7TT28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rexo1Q7TT28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rexo1Q7TT28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rexo1Q7TT28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Rexo1Q7TT28 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rexo1Q7TT28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rexo1Q7TT28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Rexo1Q7TT28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Rexo1Q7TT28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Rexo1Q7TT28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Rexo1Q7TT28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rexo1Q7TT28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Rexo1Q7TT28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,1 ms