Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clec18aQ7TSQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Clec18aQ7TSQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clec18aQ7TSQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec18aQ7TSQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec18aQ7TSQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clec18aQ7TSQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clec18aQ7TSQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clec18aQ7TSQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clec18aQ7TSQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clec18aQ7TSQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clec18aQ7TSQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clec18aQ7TSQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec18aQ7TSQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec18aQ7TSQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clec18aQ7TSQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clec18aQ7TSQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clec18aQ7TSQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec18aQ7TSQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clec18aQ7TSQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clec18aQ7TSQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clec18aQ7TSQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clec18aQ7TSQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clec18aQ7TSQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clec18aQ7TSQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec18aQ7TSQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec18aQ7TSQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clec18aQ7TSQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clec18aQ7TSQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec18aQ7TSQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clec18aQ7TSQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clec18aQ7TSQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clec18aQ7TSQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec18aQ7TSQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clec18aQ7TSQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clec18aQ7TSQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clec18aQ7TSQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Clec18aQ7TSQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clec18aQ7TSQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clec18aQ7TSQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clec18aQ7TSQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec18aQ7TSQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clec18aQ7TSQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clec18aQ7TSQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clec18aQ7TSQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clec18aQ7TSQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clec18aQ7TSQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clec18aQ7TSQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clec18aQ7TSQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec18aQ7TSQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clec18aQ7TSQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clec18aQ7TSQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec18aQ7TSQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clec18aQ7TSQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec18aQ7TSQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clec18aQ7TSQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clec18aQ7TSQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clec18aQ7TSQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clec18aQ7TSQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clec18aQ7TSQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clec18aQ7TSQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Clec18aQ7TSQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Clec18aQ7TSQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clec18aQ7TSQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clec18aQ7TSQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clec18aQ7TSQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clec18aQ7TSQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clec18aQ7TSQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clec18aQ7TSQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clec18aQ7TSQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clec18aQ7TSQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clec18aQ7TSQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clec18aQ7TSQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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