Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nphp3Q7TNH6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nphp3Q7TNH6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nphp3Q7TNH6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Nphp3Q7TNH6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Nphp3Q7TNH6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Nphp3Q7TNH6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Nphp3Q7TNH6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nphp3Q7TNH6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Nphp3Q7TNH6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Nphp3Q7TNH6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Nphp3Q7TNH6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Nphp3Q7TNH6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Nphp3Q7TNH6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Nphp3Q7TNH6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Nphp3Q7TNH6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Nphp3Q7TNH6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
Nphp3Q7TNH6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Nphp3Q7TNH6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Nphp3Q7TNH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Nphp3Q7TNH6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Nphp3Q7TNH6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Nphp3Q7TNH6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Nphp3Q7TNH6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Nphp3Q7TNH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Nphp3Q7TNH6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,97
Nphp3Q7TNH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Nphp3Q7TNH6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Nphp3Q7TNH6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Nphp3Q7TNH6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Nphp3Q7TNH6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Nphp3Q7TNH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,32■■■□□ 2,93
Nphp3Q7TNH6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Nphp3Q7TNH6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Nphp3Q7TNH6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Nphp3Q7TNH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Nphp3Q7TNH6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,23■■■□□ 2,91
Nphp3Q7TNH6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Nphp3Q7TNH6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Nphp3Q7TNH6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Nphp3Q7TNH6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Nphp3Q7TNH6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Nphp3Q7TNH6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Nphp3Q7TNH6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Nphp3Q7TNH6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Nphp3Q7TNH6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Nphp3Q7TNH6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Nphp3Q7TNH6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Nphp3Q7TNH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Nphp3Q7TNH6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Nphp3Q7TNH6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Nphp3Q7TNH6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Nphp3Q7TNH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Nphp3Q7TNH6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Nphp3Q7TNH6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Nphp3Q7TNH6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Nphp3Q7TNH6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Nphp3Q7TNH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Nphp3Q7TNH6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
Nphp3Q7TNH6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Nphp3Q7TNH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Nphp3Q7TNH6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Nphp3Q7TNH6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Nphp3Q7TNH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Nphp3Q7TNH6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Nphp3Q7TNH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Nphp3Q7TNH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Nphp3Q7TNH6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Nphp3Q7TNH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Nphp3Q7TNH6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Nphp3Q7TNH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Nphp3Q7TNH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Nphp3Q7TNH6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Nphp3Q7TNH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Nphp3Q7TNH6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Nphp3Q7TNH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Nphp3Q7TNH6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Nphp3Q7TNH6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Nphp3Q7TNH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Nphp3Q7TNH6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Nphp3Q7TNH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Nphp3Q7TNH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Nphp3Q7TNH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms