Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nphp3Q7TNH6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nphp3Q7TNH6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nphp3Q7TNH6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nphp3Q7TNH6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nphp3Q7TNH6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nphp3Q7TNH6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nphp3Q7TNH6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nphp3Q7TNH6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nphp3Q7TNH6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nphp3Q7TNH6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nphp3Q7TNH6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nphp3Q7TNH6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nphp3Q7TNH6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Nphp3Q7TNH6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nphp3Q7TNH6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nphp3Q7TNH6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Nphp3Q7TNH6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nphp3Q7TNH6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nphp3Q7TNH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nphp3Q7TNH6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nphp3Q7TNH6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Nphp3Q7TNH6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nphp3Q7TNH6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nphp3Q7TNH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nphp3Q7TNH6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Nphp3Q7TNH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nphp3Q7TNH6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nphp3Q7TNH6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nphp3Q7TNH6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nphp3Q7TNH6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nphp3Q7TNH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Nphp3Q7TNH6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nphp3Q7TNH6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Nphp3Q7TNH6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nphp3Q7TNH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nphp3Q7TNH6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Nphp3Q7TNH6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nphp3Q7TNH6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nphp3Q7TNH6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nphp3Q7TNH6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Nphp3Q7TNH6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nphp3Q7TNH6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nphp3Q7TNH6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Nphp3Q7TNH6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nphp3Q7TNH6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nphp3Q7TNH6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nphp3Q7TNH6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nphp3Q7TNH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nphp3Q7TNH6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nphp3Q7TNH6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nphp3Q7TNH6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Nphp3Q7TNH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nphp3Q7TNH6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nphp3Q7TNH6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nphp3Q7TNH6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nphp3Q7TNH6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nphp3Q7TNH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nphp3Q7TNH6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Nphp3Q7TNH6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nphp3Q7TNH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nphp3Q7TNH6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nphp3Q7TNH6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nphp3Q7TNH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nphp3Q7TNH6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nphp3Q7TNH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nphp3Q7TNH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nphp3Q7TNH6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nphp3Q7TNH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nphp3Q7TNH6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nphp3Q7TNH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Nphp3Q7TNH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nphp3Q7TNH6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nphp3Q7TNH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nphp3Q7TNH6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nphp3Q7TNH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nphp3Q7TNH6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nphp3Q7TNH6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nphp3Q7TNH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nphp3Q7TNH6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nphp3Q7TNH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nphp3Q7TNH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nphp3Q7TNH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms