Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Sbno2Q7TNB8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sbno2Q7TNB8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sbno2Q7TNB8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sbno2Q7TNB8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sbno2Q7TNB8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sbno2Q7TNB8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sbno2Q7TNB8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sbno2Q7TNB8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sbno2Q7TNB8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sbno2Q7TNB8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sbno2Q7TNB8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Sbno2Q7TNB8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Sbno2Q7TNB8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sbno2Q7TNB8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sbno2Q7TNB8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sbno2Q7TNB8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Sbno2Q7TNB8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Sbno2Q7TNB8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sbno2Q7TNB8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sbno2Q7TNB8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sbno2Q7TNB8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sbno2Q7TNB8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sbno2Q7TNB8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sbno2Q7TNB8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sbno2Q7TNB8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Sbno2Q7TNB8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sbno2Q7TNB8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sbno2Q7TNB8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Sbno2Q7TNB8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sbno2Q7TNB8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sbno2Q7TNB8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sbno2Q7TNB8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sbno2Q7TNB8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sbno2Q7TNB8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sbno2Q7TNB8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sbno2Q7TNB8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sbno2Q7TNB8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sbno2Q7TNB8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sbno2Q7TNB8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sbno2Q7TNB8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sbno2Q7TNB8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sbno2Q7TNB8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sbno2Q7TNB8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Sbno2Q7TNB8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sbno2Q7TNB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sbno2Q7TNB8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sbno2Q7TNB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno2Q7TNB8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno2Q7TNB8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno2Q7TNB8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno2Q7TNB8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno2Q7TNB8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Sbno2Q7TNB8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sbno2Q7TNB8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sbno2Q7TNB8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sbno2Q7TNB8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sbno2Q7TNB8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sbno2Q7TNB8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Sbno2Q7TNB8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sbno2Q7TNB8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sbno2Q7TNB8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sbno2Q7TNB8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sbno2Q7TNB8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sbno2Q7TNB8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sbno2Q7TNB8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sbno2Q7TNB8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sbno2Q7TNB8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sbno2Q7TNB8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sbno2Q7TNB8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sbno2Q7TNB8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sbno2Q7TNB8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno2Q7TNB8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno2Q7TNB8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno2Q7TNB8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno2Q7TNB8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno2Q7TNB8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Sbno2Q7TNB8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sbno2Q7TNB8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sbno2Q7TNB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sbno2Q7TNB8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sbno2Q7TNB8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sbno2Q7TNB8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sbno2Q7TNB8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sbno2Q7TNB8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno2Q7TNB8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sbno2Q7TNB8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms