Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Ipo8Q7TMY7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Ipo8Q7TMY7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Ipo8Q7TMY7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ipo8Q7TMY7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Ipo8Q7TMY7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Ipo8Q7TMY7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Ipo8Q7TMY7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Ipo8Q7TMY7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Ipo8Q7TMY7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ipo8Q7TMY7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Ipo8Q7TMY7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Ipo8Q7TMY7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Ipo8Q7TMY7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Ipo8Q7TMY7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ipo8Q7TMY7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ipo8Q7TMY7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ipo8Q7TMY7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Ipo8Q7TMY7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Ipo8Q7TMY7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Ipo8Q7TMY7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ipo8Q7TMY7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Ipo8Q7TMY7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ipo8Q7TMY7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ipo8Q7TMY7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Ipo8Q7TMY7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ipo8Q7TMY7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ipo8Q7TMY7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Ipo8Q7TMY7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Ipo8Q7TMY7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Ipo8Q7TMY7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Ipo8Q7TMY7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Ipo8Q7TMY7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Ipo8Q7TMY7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Ipo8Q7TMY7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Ipo8Q7TMY7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32,97■■■□□ 2,87
Ipo8Q7TMY7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Ipo8Q7TMY7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Ipo8Q7TMY7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Ipo8Q7TMY7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Ipo8Q7TMY7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Ipo8Q7TMY7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,85
Ipo8Q7TMY7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Ipo8Q7TMY7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Ipo8Q7TMY7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Ipo8Q7TMY7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Ipo8Q7TMY7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Ipo8Q7TMY7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Ipo8Q7TMY7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Ipo8Q7TMY7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Ipo8Q7TMY7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Ipo8Q7TMY7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Ipo8Q7TMY7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
Ipo8Q7TMY7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Ipo8Q7TMY7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Ipo8Q7TMY7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Ipo8Q7TMY7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Ipo8Q7TMY7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ipo8Q7TMY7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Ipo8Q7TMY7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Ipo8Q7TMY7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Ipo8Q7TMY7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Ipo8Q7TMY7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Ipo8Q7TMY7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Ipo8Q7TMY7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Ipo8Q7TMY7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Ipo8Q7TMY7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Ipo8Q7TMY7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Ipo8Q7TMY7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ipo8Q7TMY7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Ipo8Q7TMY7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Ipo8Q7TMY7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Ipo8Q7TMY7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Ipo8Q7TMY7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Ipo8Q7TMY7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Ipo8Q7TMY7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Ipo8Q7TMY7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ipo8Q7TMY7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Ipo8Q7TMY7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Ipo8Q7TMY7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Ipo8Q7TMY7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,73
Ipo8Q7TMY7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Ipo8Q7TMY7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Ipo8Q7TMY7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Ipo8Q7TMY7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Ipo8Q7TMY7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Ipo8Q7TMY7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Ipo8Q7TMY7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms