Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dsg4Q7TMD7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg4Q7TMD7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg4Q7TMD7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg4Q7TMD7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dsg4Q7TMD7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dsg4Q7TMD7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dsg4Q7TMD7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dsg4Q7TMD7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dsg4Q7TMD7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dsg4Q7TMD7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dsg4Q7TMD7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dsg4Q7TMD7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dsg4Q7TMD7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dsg4Q7TMD7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dsg4Q7TMD7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Dsg4Q7TMD7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dsg4Q7TMD7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dsg4Q7TMD7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Dsg4Q7TMD7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg4Q7TMD7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg4Q7TMD7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg4Q7TMD7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Dsg4Q7TMD7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dsg4Q7TMD7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dsg4Q7TMD7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dsg4Q7TMD7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dsg4Q7TMD7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dsg4Q7TMD7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dsg4Q7TMD7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsg4Q7TMD7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dsg4Q7TMD7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dsg4Q7TMD7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dsg4Q7TMD7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dsg4Q7TMD7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dsg4Q7TMD7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Dsg4Q7TMD7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dsg4Q7TMD7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dsg4Q7TMD7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dsg4Q7TMD7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dsg4Q7TMD7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dsg4Q7TMD7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dsg4Q7TMD7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsg4Q7TMD7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dsg4Q7TMD7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dsg4Q7TMD7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dsg4Q7TMD7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dsg4Q7TMD7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dsg4Q7TMD7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dsg4Q7TMD7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsg4Q7TMD7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsg4Q7TMD7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsg4Q7TMD7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsg4Q7TMD7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dsg4Q7TMD7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg4Q7TMD7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg4Q7TMD7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg4Q7TMD7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg4Q7TMD7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg4Q7TMD7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg4Q7TMD7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg4Q7TMD7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg4Q7TMD7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg4Q7TMD7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg4Q7TMD7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg4Q7TMD7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dsg4Q7TMD7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dsg4Q7TMD7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dsg4Q7TMD7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg4Q7TMD7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dsg4Q7TMD7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dsg4Q7TMD7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dsg4Q7TMD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg4Q7TMD7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsg4Q7TMD7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsg4Q7TMD7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms