Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TwistnbQ78WZ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TwistnbQ78WZ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TwistnbQ78WZ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TwistnbQ78WZ7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TwistnbQ78WZ7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TwistnbQ78WZ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TwistnbQ78WZ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TwistnbQ78WZ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TwistnbQ78WZ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TwistnbQ78WZ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TwistnbQ78WZ7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TwistnbQ78WZ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TwistnbQ78WZ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TwistnbQ78WZ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TwistnbQ78WZ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TwistnbQ78WZ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TwistnbQ78WZ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TwistnbQ78WZ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TwistnbQ78WZ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TwistnbQ78WZ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TwistnbQ78WZ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TwistnbQ78WZ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TwistnbQ78WZ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TwistnbQ78WZ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TwistnbQ78WZ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TwistnbQ78WZ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TwistnbQ78WZ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TwistnbQ78WZ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TwistnbQ78WZ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TwistnbQ78WZ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TwistnbQ78WZ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TwistnbQ78WZ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TwistnbQ78WZ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TwistnbQ78WZ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TwistnbQ78WZ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TwistnbQ78WZ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TwistnbQ78WZ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TwistnbQ78WZ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TwistnbQ78WZ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TwistnbQ78WZ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TwistnbQ78WZ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TwistnbQ78WZ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TwistnbQ78WZ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TwistnbQ78WZ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TwistnbQ78WZ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TwistnbQ78WZ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TwistnbQ78WZ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TwistnbQ78WZ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TwistnbQ78WZ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TwistnbQ78WZ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TwistnbQ78WZ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TwistnbQ78WZ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TwistnbQ78WZ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TwistnbQ78WZ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TwistnbQ78WZ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TwistnbQ78WZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TwistnbQ78WZ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TwistnbQ78WZ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TwistnbQ78WZ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TwistnbQ78WZ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TwistnbQ78WZ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TwistnbQ78WZ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TwistnbQ78WZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TwistnbQ78WZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TwistnbQ78WZ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TwistnbQ78WZ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TwistnbQ78WZ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms