Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnih3Q6ZWS4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnih3Q6ZWS4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnih3Q6ZWS4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnih3Q6ZWS4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnih3Q6ZWS4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnih3Q6ZWS4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnih3Q6ZWS4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnih3Q6ZWS4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnih3Q6ZWS4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnih3Q6ZWS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnih3Q6ZWS4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnih3Q6ZWS4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnih3Q6ZWS4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnih3Q6ZWS4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnih3Q6ZWS4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnih3Q6ZWS4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnih3Q6ZWS4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnih3Q6ZWS4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnih3Q6ZWS4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnih3Q6ZWS4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnih3Q6ZWS4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnih3Q6ZWS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnih3Q6ZWS4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnih3Q6ZWS4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnih3Q6ZWS4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnih3Q6ZWS4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnih3Q6ZWS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnih3Q6ZWS4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnih3Q6ZWS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnih3Q6ZWS4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnih3Q6ZWS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnih3Q6ZWS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnih3Q6ZWS4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnih3Q6ZWS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnih3Q6ZWS4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnih3Q6ZWS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnih3Q6ZWS4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnih3Q6ZWS4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnih3Q6ZWS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnih3Q6ZWS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnih3Q6ZWS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnih3Q6ZWS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnih3Q6ZWS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnih3Q6ZWS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnih3Q6ZWS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnih3Q6ZWS4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnih3Q6ZWS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnih3Q6ZWS4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnih3Q6ZWS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnih3Q6ZWS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnih3Q6ZWS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnih3Q6ZWS4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnih3Q6ZWS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnih3Q6ZWS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnih3Q6ZWS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnih3Q6ZWS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnih3Q6ZWS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnih3Q6ZWS4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms