Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnot1Q6ZQ08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot1Q6ZQ08 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnot1Q6ZQ08 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnot1Q6ZQ08 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot1Q6ZQ08 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot1Q6ZQ08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot1Q6ZQ08 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot1Q6ZQ08 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot1Q6ZQ08 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnot1Q6ZQ08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot1Q6ZQ08 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnot1Q6ZQ08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot1Q6ZQ08 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot1Q6ZQ08 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnot1Q6ZQ08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot1Q6ZQ08 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot1Q6ZQ08 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnot1Q6ZQ08 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot1Q6ZQ08 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot1Q6ZQ08 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot1Q6ZQ08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnot1Q6ZQ08 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnot1Q6ZQ08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnot1Q6ZQ08 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnot1Q6ZQ08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cnot1Q6ZQ08 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnot1Q6ZQ08 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnot1Q6ZQ08 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnot1Q6ZQ08 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnot1Q6ZQ08 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnot1Q6ZQ08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot1Q6ZQ08 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot1Q6ZQ08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnot1Q6ZQ08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot1Q6ZQ08 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnot1Q6ZQ08 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnot1Q6ZQ08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot1Q6ZQ08 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot1Q6ZQ08 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot1Q6ZQ08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot1Q6ZQ08 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot1Q6ZQ08 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot1Q6ZQ08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot1Q6ZQ08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnot1Q6ZQ08 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnot1Q6ZQ08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnot1Q6ZQ08 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot1Q6ZQ08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot1Q6ZQ08 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot1Q6ZQ08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot1Q6ZQ08 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot1Q6ZQ08 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot1Q6ZQ08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot1Q6ZQ08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot1Q6ZQ08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot1Q6ZQ08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms