Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kcnt1Q6ZPR4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kcnt1Q6ZPR4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kcnt1Q6ZPR4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kcnt1Q6ZPR4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kcnt1Q6ZPR4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kcnt1Q6ZPR4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kcnt1Q6ZPR4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kcnt1Q6ZPR4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcnt1Q6ZPR4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kcnt1Q6ZPR4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Kcnt1Q6ZPR4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcnt1Q6ZPR4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kcnt1Q6ZPR4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcnt1Q6ZPR4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kcnt1Q6ZPR4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kcnt1Q6ZPR4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcnt1Q6ZPR4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kcnt1Q6ZPR4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kcnt1Q6ZPR4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcnt1Q6ZPR4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcnt1Q6ZPR4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kcnt1Q6ZPR4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kcnt1Q6ZPR4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kcnt1Q6ZPR4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcnt1Q6ZPR4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcnt1Q6ZPR4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kcnt1Q6ZPR4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Kcnt1Q6ZPR4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kcnt1Q6ZPR4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kcnt1Q6ZPR4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kcnt1Q6ZPR4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcnt1Q6ZPR4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcnt1Q6ZPR4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcnt1Q6ZPR4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcnt1Q6ZPR4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnt1Q6ZPR4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kcnt1Q6ZPR4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kcnt1Q6ZPR4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcnt1Q6ZPR4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcnt1Q6ZPR4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcnt1Q6ZPR4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcnt1Q6ZPR4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kcnt1Q6ZPR4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnt1Q6ZPR4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kcnt1Q6ZPR4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kcnt1Q6ZPR4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kcnt1Q6ZPR4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kcnt1Q6ZPR4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kcnt1Q6ZPR4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kcnt1Q6ZPR4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnt1Q6ZPR4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnt1Q6ZPR4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnt1Q6ZPR4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnt1Q6ZPR4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnt1Q6ZPR4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnt1Q6ZPR4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnt1Q6ZPR4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnt1Q6ZPR4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnt1Q6ZPR4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnt1Q6ZPR4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnt1Q6ZPR4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnt1Q6ZPR4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnt1Q6ZPR4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnt1Q6ZPR4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnt1Q6ZPR4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnt1Q6ZPR4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnt1Q6ZPR4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms