Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPG2

Wdr90, WD repeat-containing protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 1,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr90Q6ZPG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Wdr90Q6ZPG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Wdr90Q6ZPG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Wdr90Q6ZPG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Wdr90Q6ZPG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Wdr90Q6ZPG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Wdr90Q6ZPG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Wdr90Q6ZPG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Wdr90Q6ZPG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Wdr90Q6ZPG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Wdr90Q6ZPG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Wdr90Q6ZPG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Wdr90Q6ZPG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Wdr90Q6ZPG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Wdr90Q6ZPG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Wdr90Q6ZPG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Wdr90Q6ZPG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Wdr90Q6ZPG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Wdr90Q6ZPG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Wdr90Q6ZPG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Wdr90Q6ZPG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Wdr90Q6ZPG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Wdr90Q6ZPG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Wdr90Q6ZPG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Wdr90Q6ZPG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Wdr90Q6ZPG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Wdr90Q6ZPG2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Wdr90Q6ZPG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Wdr90Q6ZPG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Wdr90Q6ZPG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Wdr90Q6ZPG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Wdr90Q6ZPG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Wdr90Q6ZPG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Wdr90Q6ZPG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Wdr90Q6ZPG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Wdr90Q6ZPG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Wdr90Q6ZPG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Wdr90Q6ZPG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Wdr90Q6ZPG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Wdr90Q6ZPG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Wdr90Q6ZPG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Wdr90Q6ZPG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Wdr90Q6ZPG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Wdr90Q6ZPG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Wdr90Q6ZPG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Wdr90Q6ZPG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Wdr90Q6ZPG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Wdr90Q6ZPG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Wdr90Q6ZPG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Wdr90Q6ZPG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Wdr90Q6ZPG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Wdr90Q6ZPG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Wdr90Q6ZPG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Wdr90Q6ZPG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Wdr90Q6ZPG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Wdr90Q6ZPG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Wdr90Q6ZPG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Wdr90Q6ZPG2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Wdr90Q6ZPG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Wdr90Q6ZPG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Wdr90Q6ZPG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Wdr90Q6ZPG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Wdr90Q6ZPG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Wdr90Q6ZPG2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Wdr90Q6ZPG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Wdr90Q6ZPG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Wdr90Q6ZPG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Wdr90Q6ZPG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Wdr90Q6ZPG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Wdr90Q6ZPG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Wdr90Q6ZPG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Wdr90Q6ZPG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Wdr90Q6ZPG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Wdr90Q6ZPG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Wdr90Q6ZPG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Wdr90Q6ZPG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Wdr90Q6ZPG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Wdr90Q6ZPG2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Wdr90Q6ZPG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Wdr90Q6ZPG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Wdr90Q6ZPG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Wdr90Q6ZPG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Wdr90Q6ZPG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Wdr90Q6ZPG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Wdr90Q6ZPG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Wdr90Q6ZPG2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Wdr90Q6ZPG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Wdr90Q6ZPG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Wdr90Q6ZPG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Wdr90Q6ZPG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Wdr90Q6ZPG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Wdr90Q6ZPG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Wdr90Q6ZPG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Wdr90Q6ZPG2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms