Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Opn5Q6VZZ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Opn5Q6VZZ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Opn5Q6VZZ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Opn5Q6VZZ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Opn5Q6VZZ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Opn5Q6VZZ7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Opn5Q6VZZ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Opn5Q6VZZ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn5Q6VZZ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Opn5Q6VZZ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Opn5Q6VZZ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Opn5Q6VZZ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Opn5Q6VZZ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Opn5Q6VZZ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Opn5Q6VZZ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Opn5Q6VZZ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Opn5Q6VZZ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Opn5Q6VZZ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Opn5Q6VZZ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Opn5Q6VZZ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Opn5Q6VZZ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Opn5Q6VZZ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Opn5Q6VZZ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Opn5Q6VZZ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Opn5Q6VZZ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Opn5Q6VZZ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Opn5Q6VZZ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Opn5Q6VZZ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Opn5Q6VZZ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Opn5Q6VZZ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Opn5Q6VZZ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Opn5Q6VZZ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Opn5Q6VZZ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Opn5Q6VZZ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Opn5Q6VZZ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Opn5Q6VZZ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Opn5Q6VZZ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Opn5Q6VZZ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Opn5Q6VZZ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Opn5Q6VZZ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Opn5Q6VZZ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Opn5Q6VZZ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Opn5Q6VZZ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Opn5Q6VZZ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Opn5Q6VZZ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Opn5Q6VZZ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Opn5Q6VZZ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Opn5Q6VZZ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Opn5Q6VZZ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Opn5Q6VZZ7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Opn5Q6VZZ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Opn5Q6VZZ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Opn5Q6VZZ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Opn5Q6VZZ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Opn5Q6VZZ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Opn5Q6VZZ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Opn5Q6VZZ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Opn5Q6VZZ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opn5Q6VZZ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Opn5Q6VZZ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Opn5Q6VZZ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Opn5Q6VZZ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opn5Q6VZZ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opn5Q6VZZ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Opn5Q6VZZ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Opn5Q6VZZ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Opn5Q6VZZ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Opn5Q6VZZ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opn5Q6VZZ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opn5Q6VZZ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opn5Q6VZZ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms