Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfap2eQ6VUP9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfap2eQ6VUP9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfap2eQ6VUP9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfap2eQ6VUP9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfap2eQ6VUP9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfap2eQ6VUP9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfap2eQ6VUP9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfap2eQ6VUP9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfap2eQ6VUP9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfap2eQ6VUP9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfap2eQ6VUP9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfap2eQ6VUP9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfap2eQ6VUP9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfap2eQ6VUP9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfap2eQ6VUP9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfap2eQ6VUP9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap2eQ6VUP9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap2eQ6VUP9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap2eQ6VUP9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfap2eQ6VUP9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap2eQ6VUP9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap2eQ6VUP9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap2eQ6VUP9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap2eQ6VUP9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap2eQ6VUP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfap2eQ6VUP9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfap2eQ6VUP9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfap2eQ6VUP9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfap2eQ6VUP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfap2eQ6VUP9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfap2eQ6VUP9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfap2eQ6VUP9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfap2eQ6VUP9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfap2eQ6VUP9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfap2eQ6VUP9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfap2eQ6VUP9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfap2eQ6VUP9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfap2eQ6VUP9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfap2eQ6VUP9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfap2eQ6VUP9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfap2eQ6VUP9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfap2eQ6VUP9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfap2eQ6VUP9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfap2eQ6VUP9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfap2eQ6VUP9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfap2eQ6VUP9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfap2eQ6VUP9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tfap2eQ6VUP9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfap2eQ6VUP9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfap2eQ6VUP9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tfap2eQ6VUP9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2eQ6VUP9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfap2eQ6VUP9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfap2eQ6VUP9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2eQ6VUP9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tfap2eQ6VUP9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap2eQ6VUP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms