Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GcsamQ6RFH4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GcsamQ6RFH4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GcsamQ6RFH4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GcsamQ6RFH4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GcsamQ6RFH4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GcsamQ6RFH4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GcsamQ6RFH4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GcsamQ6RFH4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GcsamQ6RFH4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GcsamQ6RFH4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcsamQ6RFH4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcsamQ6RFH4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GcsamQ6RFH4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GcsamQ6RFH4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcsamQ6RFH4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GcsamQ6RFH4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GcsamQ6RFH4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GcsamQ6RFH4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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