Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Atp2b4Q6Q477 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Atp2b4Q6Q477 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Atp2b4Q6Q477 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Atp2b4Q6Q477 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Atp2b4Q6Q477 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atp2b4Q6Q477 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atp2b4Q6Q477 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Atp2b4Q6Q477 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Atp2b4Q6Q477 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Atp2b4Q6Q477 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Atp2b4Q6Q477 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Atp2b4Q6Q477 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Atp2b4Q6Q477 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Atp2b4Q6Q477 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,26■■■■□ 3,07
Atp2b4Q6Q477 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Atp2b4Q6Q477 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Atp2b4Q6Q477 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atp2b4Q6Q477 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atp2b4Q6Q477 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Atp2b4Q6Q477 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Atp2b4Q6Q477 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Atp2b4Q6Q477 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Atp2b4Q6Q477 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Atp2b4Q6Q477 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Atp2b4Q6Q477 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Atp2b4Q6Q477 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Atp2b4Q6Q477 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Atp2b4Q6Q477 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Atp2b4Q6Q477 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Atp2b4Q6Q477 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Atp2b4Q6Q477 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Atp2b4Q6Q477 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Atp2b4Q6Q477 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Atp2b4Q6Q477 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Atp2b4Q6Q477 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Atp2b4Q6Q477 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Atp2b4Q6Q477 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,82■■■■□ 3
Atp2b4Q6Q477 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Atp2b4Q6Q477 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Atp2b4Q6Q477 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Atp2b4Q6Q477 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Atp2b4Q6Q477 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Atp2b4Q6Q477 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Atp2b4Q6Q477 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Atp2b4Q6Q477 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Atp2b4Q6Q477 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Atp2b4Q6Q477 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Atp2b4Q6Q477 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,57■■■□□ 2,96
Atp2b4Q6Q477 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Atp2b4Q6Q477 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Atp2b4Q6Q477 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Atp2b4Q6Q477 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Atp2b4Q6Q477 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Atp2b4Q6Q477 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Atp2b4Q6Q477 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Atp2b4Q6Q477 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Atp2b4Q6Q477 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Atp2b4Q6Q477 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Atp2b4Q6Q477 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Atp2b4Q6Q477 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Atp2b4Q6Q477 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Atp2b4Q6Q477 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Atp2b4Q6Q477 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Atp2b4Q6Q477 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Atp2b4Q6Q477 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Atp2b4Q6Q477 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Atp2b4Q6Q477 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Atp2b4Q6Q477 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Atp2b4Q6Q477 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Atp2b4Q6Q477 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Atp2b4Q6Q477 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Atp2b4Q6Q477 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Atp2b4Q6Q477 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Atp2b4Q6Q477 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Atp2b4Q6Q477 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Atp2b4Q6Q477 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Atp2b4Q6Q477 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Atp2b4Q6Q477 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Atp2b4Q6Q477 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Atp2b4Q6Q477 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Atp2b4Q6Q477 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Atp2b4Q6Q477 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Atp2b4Q6Q477 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Atp2b4Q6Q477 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms