Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab35Q6PHN9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab35Q6PHN9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab35Q6PHN9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab35Q6PHN9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab35Q6PHN9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab35Q6PHN9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab35Q6PHN9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab35Q6PHN9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab35Q6PHN9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab35Q6PHN9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab35Q6PHN9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab35Q6PHN9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab35Q6PHN9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab35Q6PHN9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab35Q6PHN9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab35Q6PHN9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab35Q6PHN9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab35Q6PHN9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab35Q6PHN9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab35Q6PHN9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab35Q6PHN9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab35Q6PHN9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab35Q6PHN9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab35Q6PHN9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab35Q6PHN9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab35Q6PHN9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab35Q6PHN9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab35Q6PHN9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab35Q6PHN9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab35Q6PHN9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab35Q6PHN9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab35Q6PHN9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab35Q6PHN9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab35Q6PHN9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab35Q6PHN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab35Q6PHN9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab35Q6PHN9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab35Q6PHN9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab35Q6PHN9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab35Q6PHN9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab35Q6PHN9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab35Q6PHN9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab35Q6PHN9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab35Q6PHN9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab35Q6PHN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab35Q6PHN9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab35Q6PHN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab35Q6PHN9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab35Q6PHN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab35Q6PHN9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab35Q6PHN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab35Q6PHN9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab35Q6PHN9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab35Q6PHN9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab35Q6PHN9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab35Q6PHN9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab35Q6PHN9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab35Q6PHN9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab35Q6PHN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab35Q6PHN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab35Q6PHN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab35Q6PHN9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab35Q6PHN9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab35Q6PHN9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab35Q6PHN9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab35Q6PHN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab35Q6PHN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab35Q6PHN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms