Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Zbtb39Q6PDK0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Zbtb39Q6PDK0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Zbtb39Q6PDK0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Zbtb39Q6PDK0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Zbtb39Q6PDK0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Zbtb39Q6PDK0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Zbtb39Q6PDK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Zbtb39Q6PDK0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Zbtb39Q6PDK0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Zbtb39Q6PDK0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Zbtb39Q6PDK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Zbtb39Q6PDK0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Zbtb39Q6PDK0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Zbtb39Q6PDK0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Zbtb39Q6PDK0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Zbtb39Q6PDK0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Zbtb39Q6PDK0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Zbtb39Q6PDK0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Zbtb39Q6PDK0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Zbtb39Q6PDK0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Zbtb39Q6PDK0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Zbtb39Q6PDK0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Zbtb39Q6PDK0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Zbtb39Q6PDK0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Zbtb39Q6PDK0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
Zbtb39Q6PDK0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Zbtb39Q6PDK0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Zbtb39Q6PDK0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Zbtb39Q6PDK0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Zbtb39Q6PDK0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Zbtb39Q6PDK0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Zbtb39Q6PDK0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Zbtb39Q6PDK0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Zbtb39Q6PDK0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Zbtb39Q6PDK0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Zbtb39Q6PDK0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Zbtb39Q6PDK0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Zbtb39Q6PDK0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Zbtb39Q6PDK0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Zbtb39Q6PDK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Zbtb39Q6PDK0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Zbtb39Q6PDK0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
Zbtb39Q6PDK0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Zbtb39Q6PDK0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Zbtb39Q6PDK0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Zbtb39Q6PDK0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Zbtb39Q6PDK0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Zbtb39Q6PDK0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Zbtb39Q6PDK0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Zbtb39Q6PDK0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Zbtb39Q6PDK0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Zbtb39Q6PDK0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Zbtb39Q6PDK0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Zbtb39Q6PDK0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Zbtb39Q6PDK0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Zbtb39Q6PDK0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Zbtb39Q6PDK0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Zbtb39Q6PDK0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Zbtb39Q6PDK0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Zbtb39Q6PDK0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Zbtb39Q6PDK0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Zbtb39Q6PDK0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Zbtb39Q6PDK0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Zbtb39Q6PDK0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Zbtb39Q6PDK0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Zbtb39Q6PDK0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Zbtb39Q6PDK0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Zbtb39Q6PDK0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Zbtb39Q6PDK0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Zbtb39Q6PDK0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Zbtb39Q6PDK0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Zbtb39Q6PDK0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Zbtb39Q6PDK0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Zbtb39Q6PDK0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Zbtb39Q6PDK0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Zbtb39Q6PDK0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Zbtb39Q6PDK0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Zbtb39Q6PDK0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Zbtb39Q6PDK0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Zbtb39Q6PDK0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Zbtb39Q6PDK0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Zbtb39Q6PDK0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Zbtb39Q6PDK0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms