Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc3bQ6PDC0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc3bQ6PDC0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc3bQ6PDC0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rundc3bQ6PDC0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc3bQ6PDC0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc3bQ6PDC0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rundc3bQ6PDC0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc3bQ6PDC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc3bQ6PDC0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc3bQ6PDC0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc3bQ6PDC0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc3bQ6PDC0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc3bQ6PDC0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rundc3bQ6PDC0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc3bQ6PDC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc3bQ6PDC0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc3bQ6PDC0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc3bQ6PDC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc3bQ6PDC0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc3bQ6PDC0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc3bQ6PDC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc3bQ6PDC0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc3bQ6PDC0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc3bQ6PDC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc3bQ6PDC0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rundc3bQ6PDC0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc3bQ6PDC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc3bQ6PDC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc3bQ6PDC0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc3bQ6PDC0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc3bQ6PDC0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc3bQ6PDC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc3bQ6PDC0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc3bQ6PDC0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc3bQ6PDC0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc3bQ6PDC0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc3bQ6PDC0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rundc3bQ6PDC0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc3bQ6PDC0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc3bQ6PDC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc3bQ6PDC0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc3bQ6PDC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc3bQ6PDC0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc3bQ6PDC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc3bQ6PDC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc3bQ6PDC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc3bQ6PDC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc3bQ6PDC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rundc3bQ6PDC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc3bQ6PDC0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc3bQ6PDC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc3bQ6PDC0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc3bQ6PDC0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc3bQ6PDC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc3bQ6PDC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc3bQ6PDC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc3bQ6PDC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc3bQ6PDC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc3bQ6PDC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc3bQ6PDC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc3bQ6PDC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc3bQ6PDC0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rundc3bQ6PDC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc3bQ6PDC0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc3bQ6PDC0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms