Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Prkab2Q6PAM0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Prkab2Q6PAM0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Prkab2Q6PAM0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Prkab2Q6PAM0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Prkab2Q6PAM0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Prkab2Q6PAM0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Prkab2Q6PAM0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Prkab2Q6PAM0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Prkab2Q6PAM0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Prkab2Q6PAM0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,51■■■■□ 3,28
Prkab2Q6PAM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Prkab2Q6PAM0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Prkab2Q6PAM0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Prkab2Q6PAM0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Prkab2Q6PAM0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Prkab2Q6PAM0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Prkab2Q6PAM0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Prkab2Q6PAM0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Prkab2Q6PAM0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Prkab2Q6PAM0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Prkab2Q6PAM0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Prkab2Q6PAM0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Prkab2Q6PAM0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Prkab2Q6PAM0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Prkab2Q6PAM0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Prkab2Q6PAM0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Prkab2Q6PAM0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Prkab2Q6PAM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Prkab2Q6PAM0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Prkab2Q6PAM0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Prkab2Q6PAM0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Prkab2Q6PAM0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Prkab2Q6PAM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Prkab2Q6PAM0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Prkab2Q6PAM0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Prkab2Q6PAM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Prkab2Q6PAM0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Prkab2Q6PAM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Prkab2Q6PAM0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Prkab2Q6PAM0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Prkab2Q6PAM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,82■■■■□ 3,16
Prkab2Q6PAM0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Prkab2Q6PAM0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Prkab2Q6PAM0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,72■■■■□ 3,15
Prkab2Q6PAM0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Prkab2Q6PAM0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Prkab2Q6PAM0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Prkab2Q6PAM0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Prkab2Q6PAM0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Prkab2Q6PAM0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Prkab2Q6PAM0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,57■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Prkab2Q6PAM0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Prkab2Q6PAM0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Prkab2Q6PAM0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Prkab2Q6PAM0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Prkab2Q6PAM0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Prkab2Q6PAM0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Prkab2Q6PAM0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Prkab2Q6PAM0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Prkab2Q6PAM0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Prkab2Q6PAM0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Prkab2Q6PAM0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Prkab2Q6PAM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Prkab2Q6PAM0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Prkab2Q6PAM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Prkab2Q6PAM0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Prkab2Q6PAM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Prkab2Q6PAM0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Prkab2Q6PAM0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Prkab2Q6PAM0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Prkab2Q6PAM0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Prkab2Q6PAM0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Prkab2Q6PAM0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Prkab2Q6PAM0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Prkab2Q6PAM0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,93■■■■□ 3,02
Prkab2Q6PAM0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Prkab2Q6PAM0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Prkab2Q6PAM0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Prkab2Q6PAM0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Prkab2Q6PAM0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Prkab2Q6PAM0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Prkab2Q6PAM0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Prkab2Q6PAM0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Prkab2Q6PAM0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Prkab2Q6PAM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,4 ms