Protein–RNA interactions for Protein: Q6P205

Xlr3b, X-linked lymphocyte-regulated protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3bQ6P205 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Xlr3bQ6P205 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Xlr3bQ6P205 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Xlr3bQ6P205 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Xlr3bQ6P205 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Xlr3bQ6P205 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Xlr3bQ6P205 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Xlr3bQ6P205 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Xlr3bQ6P205 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Xlr3bQ6P205 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Xlr3bQ6P205 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Xlr3bQ6P205 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Xlr3bQ6P205 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Xlr3bQ6P205 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Xlr3bQ6P205 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Xlr3bQ6P205 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Xlr3bQ6P205 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Xlr3bQ6P205 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Xlr3bQ6P205 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Xlr3bQ6P205 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Xlr3bQ6P205 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xlr3bQ6P205 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xlr3bQ6P205 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xlr3bQ6P205 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Xlr3bQ6P205 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Xlr3bQ6P205 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Xlr3bQ6P205 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Xlr3bQ6P205 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Xlr3bQ6P205 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Xlr3bQ6P205 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Xlr3bQ6P205 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Xlr3bQ6P205 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xlr3bQ6P205 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xlr3bQ6P205 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Xlr3bQ6P205 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Xlr3bQ6P205 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xlr3bQ6P205 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xlr3bQ6P205 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Xlr3bQ6P205 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xlr3bQ6P205 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Xlr3bQ6P205 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xlr3bQ6P205 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xlr3bQ6P205 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xlr3bQ6P205 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xlr3bQ6P205 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xlr3bQ6P205 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Xlr3bQ6P205 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Xlr3bQ6P205 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Xlr3bQ6P205 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Xlr3bQ6P205 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Xlr3bQ6P205 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Xlr3bQ6P205 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Xlr3bQ6P205 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Xlr3bQ6P205 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Xlr3bQ6P205 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xlr3bQ6P205 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xlr3bQ6P205 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xlr3bQ6P205 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Xlr3bQ6P205 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Xlr3bQ6P205 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Xlr3bQ6P205 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Xlr3bQ6P205 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Xlr3bQ6P205 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Xlr3bQ6P205 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms