Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Szrd1Q6NXN1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Szrd1Q6NXN1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Szrd1Q6NXN1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Szrd1Q6NXN1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Szrd1Q6NXN1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Szrd1Q6NXN1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Szrd1Q6NXN1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Szrd1Q6NXN1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Szrd1Q6NXN1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Szrd1Q6NXN1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Szrd1Q6NXN1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Szrd1Q6NXN1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Szrd1Q6NXN1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Szrd1Q6NXN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Szrd1Q6NXN1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Szrd1Q6NXN1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Szrd1Q6NXN1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Szrd1Q6NXN1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Szrd1Q6NXN1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Szrd1Q6NXN1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Szrd1Q6NXN1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Szrd1Q6NXN1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Szrd1Q6NXN1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Szrd1Q6NXN1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Szrd1Q6NXN1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Szrd1Q6NXN1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Szrd1Q6NXN1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Szrd1Q6NXN1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Szrd1Q6NXN1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Szrd1Q6NXN1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Szrd1Q6NXN1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Szrd1Q6NXN1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Szrd1Q6NXN1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Szrd1Q6NXN1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Szrd1Q6NXN1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Szrd1Q6NXN1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Szrd1Q6NXN1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Szrd1Q6NXN1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Szrd1Q6NXN1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Szrd1Q6NXN1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Szrd1Q6NXN1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Szrd1Q6NXN1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Szrd1Q6NXN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Szrd1Q6NXN1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Szrd1Q6NXN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Szrd1Q6NXN1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Szrd1Q6NXN1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Szrd1Q6NXN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Szrd1Q6NXN1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Szrd1Q6NXN1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Szrd1Q6NXN1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Szrd1Q6NXN1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Szrd1Q6NXN1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Szrd1Q6NXN1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Szrd1Q6NXN1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Szrd1Q6NXN1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Szrd1Q6NXN1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Szrd1Q6NXN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Szrd1Q6NXN1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Szrd1Q6NXN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Szrd1Q6NXN1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Szrd1Q6NXN1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Szrd1Q6NXN1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Szrd1Q6NXN1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms