Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2810408A11RikQ6NSU2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2810408A11RikQ6NSU2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2810408A11RikQ6NSU2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2810408A11RikQ6NSU2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
2810408A11RikQ6NSU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2810408A11RikQ6NSU2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2810408A11RikQ6NSU2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2810408A11RikQ6NSU2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2810408A11RikQ6NSU2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2810408A11RikQ6NSU2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2810408A11RikQ6NSU2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2810408A11RikQ6NSU2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2810408A11RikQ6NSU2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2810408A11RikQ6NSU2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2810408A11RikQ6NSU2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2810408A11RikQ6NSU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2810408A11RikQ6NSU2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2810408A11RikQ6NSU2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2810408A11RikQ6NSU2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
2810408A11RikQ6NSU2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2810408A11RikQ6NSU2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2810408A11RikQ6NSU2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
2810408A11RikQ6NSU2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
2810408A11RikQ6NSU2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2810408A11RikQ6NSU2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2810408A11RikQ6NSU2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
2810408A11RikQ6NSU2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
2810408A11RikQ6NSU2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
2810408A11RikQ6NSU2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
2810408A11RikQ6NSU2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2810408A11RikQ6NSU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2810408A11RikQ6NSU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2810408A11RikQ6NSU2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
2810408A11RikQ6NSU2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
2810408A11RikQ6NSU2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
2810408A11RikQ6NSU2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2810408A11RikQ6NSU2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2810408A11RikQ6NSU2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2810408A11RikQ6NSU2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2810408A11RikQ6NSU2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms