Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cep290Q6A078 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cep290Q6A078 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cep290Q6A078 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep290Q6A078 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cep290Q6A078 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep290Q6A078 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep290Q6A078 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cep290Q6A078 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cep290Q6A078 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cep290Q6A078 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cep290Q6A078 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep290Q6A078 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep290Q6A078 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep290Q6A078 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep290Q6A078 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep290Q6A078 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep290Q6A078 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep290Q6A078 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep290Q6A078 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep290Q6A078 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep290Q6A078 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep290Q6A078 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep290Q6A078 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep290Q6A078 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cep290Q6A078 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep290Q6A078 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep290Q6A078 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep290Q6A078 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep290Q6A078 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep290Q6A078 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep290Q6A078 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep290Q6A078 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep290Q6A078 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep290Q6A078 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep290Q6A078 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep290Q6A078 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep290Q6A078 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep290Q6A078 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep290Q6A078 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep290Q6A078 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep290Q6A078 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep290Q6A078 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cep290Q6A078 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cep290Q6A078 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep290Q6A078 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep290Q6A078 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep290Q6A078 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep290Q6A078 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cep290Q6A078 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cep290Q6A078 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep290Q6A078 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cep290Q6A078 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep290Q6A078 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep290Q6A078 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep290Q6A078 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep290Q6A078 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep290Q6A078 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep290Q6A078 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep290Q6A078 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep290Q6A078 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep290Q6A078 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep290Q6A078 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cep290Q6A078 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep290Q6A078 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep290Q6A078 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cep290Q6A078 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cep290Q6A078 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep290Q6A078 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cep290Q6A078 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cep290Q6A078 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cep290Q6A078 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep290Q6A078 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep290Q6A078 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep290Q6A078 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cep290Q6A078 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cep290Q6A078 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep290Q6A078 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep290Q6A078 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cep290Q6A078 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep290Q6A078 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep290Q6A078 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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