Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cdk13Q69ZA1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cdk13Q69ZA1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Cdk13Q69ZA1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Cdk13Q69ZA1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cdk13Q69ZA1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Cdk13Q69ZA1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cdk13Q69ZA1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cdk13Q69ZA1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Cdk13Q69ZA1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
Cdk13Q69ZA1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Cdk13Q69ZA1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
Cdk13Q69ZA1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cdk13Q69ZA1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cdk13Q69ZA1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cdk13Q69ZA1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Cdk13Q69ZA1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Cdk13Q69ZA1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cdk13Q69ZA1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Cdk13Q69ZA1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Cdk13Q69ZA1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Cdk13Q69ZA1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Cdk13Q69ZA1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Cdk13Q69ZA1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Cdk13Q69ZA1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Cdk13Q69ZA1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cdk13Q69ZA1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cdk13Q69ZA1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Cdk13Q69ZA1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Cdk13Q69ZA1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Cdk13Q69ZA1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Cdk13Q69ZA1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Cdk13Q69ZA1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cdk13Q69ZA1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Cdk13Q69ZA1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Cdk13Q69ZA1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cdk13Q69ZA1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Cdk13Q69ZA1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cdk13Q69ZA1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Cdk13Q69ZA1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Cdk13Q69ZA1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Cdk13Q69ZA1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Cdk13Q69ZA1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Cdk13Q69ZA1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cdk13Q69ZA1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Cdk13Q69ZA1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cdk13Q69ZA1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cdk13Q69ZA1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cdk13Q69ZA1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cdk13Q69ZA1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Cdk13Q69ZA1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Cdk13Q69ZA1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cdk13Q69ZA1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Cdk13Q69ZA1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cdk13Q69ZA1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cdk13Q69ZA1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cdk13Q69ZA1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Cdk13Q69ZA1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cdk13Q69ZA1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cdk13Q69ZA1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cdk13Q69ZA1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Cdk13Q69ZA1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cdk13Q69ZA1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cdk13Q69ZA1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cdk13Q69ZA1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Cdk13Q69ZA1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cdk13Q69ZA1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cdk13Q69ZA1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Cdk13Q69ZA1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cdk13Q69ZA1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Cdk13Q69ZA1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cdk13Q69ZA1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cdk13Q69ZA1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Cdk13Q69ZA1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cdk13Q69ZA1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Cdk13Q69ZA1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cdk13Q69ZA1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Cdk13Q69ZA1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Cdk13Q69ZA1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cdk13Q69ZA1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Cdk13Q69ZA1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cdk13Q69ZA1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cdk13Q69ZA1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cdk13Q69ZA1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Cdk13Q69ZA1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cdk13Q69ZA1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cdk13Q69ZA1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cdk13Q69ZA1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Cdk13Q69ZA1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cdk13Q69ZA1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cdk13Q69ZA1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cdk13Q69ZA1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms