Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Samd9lQ69Z37 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Samd9lQ69Z37 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Samd9lQ69Z37 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Samd9lQ69Z37 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Samd9lQ69Z37 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
Samd9lQ69Z37 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Samd9lQ69Z37 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
Samd9lQ69Z37 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Samd9lQ69Z37 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Samd9lQ69Z37 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Samd9lQ69Z37 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Samd9lQ69Z37 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Samd9lQ69Z37 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Samd9lQ69Z37 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Samd9lQ69Z37 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Samd9lQ69Z37 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Samd9lQ69Z37 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Samd9lQ69Z37 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Samd9lQ69Z37 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Samd9lQ69Z37 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Samd9lQ69Z37 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Samd9lQ69Z37 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Samd9lQ69Z37 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Samd9lQ69Z37 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
Samd9lQ69Z37 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Samd9lQ69Z37 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Samd9lQ69Z37 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Samd9lQ69Z37 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Samd9lQ69Z37 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Samd9lQ69Z37 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Samd9lQ69Z37 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC45.38■■■■■ 4.85
Samd9lQ69Z37 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Samd9lQ69Z37 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Samd9lQ69Z37 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
Samd9lQ69Z37 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Samd9lQ69Z37 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Samd9lQ69Z37 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Samd9lQ69Z37 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Samd9lQ69Z37 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Samd9lQ69Z37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Samd9lQ69Z37 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
Samd9lQ69Z37 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
Samd9lQ69Z37 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Samd9lQ69Z37 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Samd9lQ69Z37 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Samd9lQ69Z37 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Samd9lQ69Z37 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Samd9lQ69Z37 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Samd9lQ69Z37 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Samd9lQ69Z37 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Samd9lQ69Z37 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Samd9lQ69Z37 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Samd9lQ69Z37 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Samd9lQ69Z37 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Samd9lQ69Z37 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Samd9lQ69Z37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Samd9lQ69Z37 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Samd9lQ69Z37 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Samd9lQ69Z37 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Samd9lQ69Z37 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.75
Samd9lQ69Z37 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
Samd9lQ69Z37 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Samd9lQ69Z37 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Samd9lQ69Z37 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Samd9lQ69Z37 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Samd9lQ69Z37 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Samd9lQ69Z37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Samd9lQ69Z37 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
Samd9lQ69Z37 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
Samd9lQ69Z37 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Samd9lQ69Z37 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Samd9lQ69Z37 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Samd9lQ69Z37 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Samd9lQ69Z37 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Samd9lQ69Z37 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
Samd9lQ69Z37 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Samd9lQ69Z37 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Samd9lQ69Z37 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Samd9lQ69Z37 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Samd9lQ69Z37 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Samd9lQ69Z37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms