Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Nr2e1Q64104 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nr2e1Q64104 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nr2e1Q64104 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nr2e1Q64104 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nr2e1Q64104 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nr2e1Q64104 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nr2e1Q64104 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nr2e1Q64104 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nr2e1Q64104 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nr2e1Q64104 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nr2e1Q64104 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nr2e1Q64104 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nr2e1Q64104 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Nr2e1Q64104 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nr2e1Q64104 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nr2e1Q64104 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nr2e1Q64104 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nr2e1Q64104 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nr2e1Q64104 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nr2e1Q64104 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nr2e1Q64104 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nr2e1Q64104 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nr2e1Q64104 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nr2e1Q64104 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nr2e1Q64104 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nr2e1Q64104 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nr2e1Q64104 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nr2e1Q64104 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nr2e1Q64104 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nr2e1Q64104 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nr2e1Q64104 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nr2e1Q64104 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nr2e1Q64104 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nr2e1Q64104 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nr2e1Q64104 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nr2e1Q64104 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nr2e1Q64104 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nr2e1Q64104 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nr2e1Q64104 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nr2e1Q64104 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nr2e1Q64104 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nr2e1Q64104 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nr2e1Q64104 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nr2e1Q64104 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nr2e1Q64104 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Nr2e1Q64104 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nr2e1Q64104 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nr2e1Q64104 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nr2e1Q64104 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nr2e1Q64104 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nr2e1Q64104 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nr2e1Q64104 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nr2e1Q64104 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nr2e1Q64104 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nr2e1Q64104 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nr2e1Q64104 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nr2e1Q64104 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nr2e1Q64104 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nr2e1Q64104 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nr2e1Q64104 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nr2e1Q64104 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nr2e1Q64104 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nr2e1Q64104 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nr2e1Q64104 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nr2e1Q64104 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nr2e1Q64104 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nr2e1Q64104 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nr2e1Q64104 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nr2e1Q64104 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nr2e1Q64104 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nr2e1Q64104 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nr2e1Q64104 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nr2e1Q64104 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nr2e1Q64104 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nr2e1Q64104 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nr2e1Q64104 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nr2e1Q64104 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms