Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Vil1Q62468 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Vil1Q62468 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Vil1Q62468 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Vil1Q62468 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Vil1Q62468 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Vil1Q62468 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Vil1Q62468 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Vil1Q62468 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Vil1Q62468 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Vil1Q62468 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Vil1Q62468 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Vil1Q62468 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Vil1Q62468 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Vil1Q62468 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Vil1Q62468 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Vil1Q62468 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Vil1Q62468 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Vil1Q62468 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Vil1Q62468 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Vil1Q62468 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,78■■■■□ 3
Vil1Q62468 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,77■■■■□ 3
Vil1Q62468 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Vil1Q62468 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Vil1Q62468 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Vil1Q62468 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Vil1Q62468 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vil1Q62468 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Vil1Q62468 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Vil1Q62468 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Vil1Q62468 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Vil1Q62468 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Vil1Q62468 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Vil1Q62468 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Vil1Q62468 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,55■■■□□ 2,96
Vil1Q62468 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Vil1Q62468 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Vil1Q62468 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Vil1Q62468 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Vil1Q62468 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Vil1Q62468 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Vil1Q62468 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Vil1Q62468 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,44■■■□□ 2,94
Vil1Q62468 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Vil1Q62468 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Vil1Q62468 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Vil1Q62468 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,26■■■□□ 2,91
Vil1Q62468 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Vil1Q62468 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Vil1Q62468 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Vil1Q62468 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Vil1Q62468 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vil1Q62468 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Vil1Q62468 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vil1Q62468 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Vil1Q62468 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Vil1Q62468 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Vil1Q62468 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Vil1Q62468 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Vil1Q62468 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Vil1Q62468 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Vil1Q62468 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vil1Q62468 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vil1Q62468 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Vil1Q62468 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Vil1Q62468 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Vil1Q62468 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Vil1Q62468 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Vil1Q62468 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Vil1Q62468 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Vil1Q62468 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Vil1Q62468 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
Vil1Q62468 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Vil1Q62468 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Vil1Q62468 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vil1Q62468 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vil1Q62468 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vil1Q62468 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Vil1Q62468 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Vil1Q62468 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vil1Q62468 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Vil1Q62468 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Vil1Q62468 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Vil1Q62468 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Vil1Q62468 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
Vil1Q62468 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Vil1Q62468 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms