Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Vil1Q62468 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Vil1Q62468 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Vil1Q62468 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Vil1Q62468 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Vil1Q62468 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Vil1Q62468 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Vil1Q62468 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Vil1Q62468 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Vil1Q62468 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Vil1Q62468 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Vil1Q62468 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Vil1Q62468 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Vil1Q62468 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Vil1Q62468 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Vil1Q62468 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Vil1Q62468 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Vil1Q62468 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Vil1Q62468 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Vil1Q62468 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Vil1Q62468 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Vil1Q62468 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Vil1Q62468 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Vil1Q62468 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Vil1Q62468 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Vil1Q62468 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Vil1Q62468 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Vil1Q62468 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Vil1Q62468 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Vil1Q62468 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Vil1Q62468 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Vil1Q62468 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Vil1Q62468 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Vil1Q62468 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Vil1Q62468 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Vil1Q62468 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Vil1Q62468 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Vil1Q62468 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Vil1Q62468 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Vil1Q62468 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Vil1Q62468 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Vil1Q62468 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Vil1Q62468 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Vil1Q62468 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Vil1Q62468 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Vil1Q62468 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Vil1Q62468 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Vil1Q62468 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Vil1Q62468 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Vil1Q62468 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Vil1Q62468 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Vil1Q62468 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Vil1Q62468 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Vil1Q62468 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Vil1Q62468 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Vil1Q62468 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Vil1Q62468 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Vil1Q62468 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Vil1Q62468 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Vil1Q62468 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Vil1Q62468 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Vil1Q62468 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Vil1Q62468 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Vil1Q62468 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Vil1Q62468 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Vil1Q62468 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Vil1Q62468 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Vil1Q62468 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Vil1Q62468 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Vil1Q62468 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Vil1Q62468 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Vil1Q62468 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Vil1Q62468 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Vil1Q62468 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Vil1Q62468 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Vil1Q62468 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Vil1Q62468 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Vil1Q62468 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Vil1Q62468 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Vil1Q62468 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Vil1Q62468 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Vil1Q62468 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Vil1Q62468 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Vil1Q62468 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Vil1Q62468 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Vil1Q62468 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Vil1Q62468 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms