Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
CcncQ62447 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
CcncQ62447 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
CcncQ62447 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
CcncQ62447 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
CcncQ62447 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
CcncQ62447 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
CcncQ62447 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
CcncQ62447 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
CcncQ62447 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
CcncQ62447 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
CcncQ62447 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,82■■■□□ 2,04
CcncQ62447 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
CcncQ62447 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,78■■■□□ 2,04
CcncQ62447 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
CcncQ62447 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
CcncQ62447 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
CcncQ62447 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CcncQ62447 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CcncQ62447 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CcncQ62447 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
CcncQ62447 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
CcncQ62447 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
CcncQ62447 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
CcncQ62447 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
CcncQ62447 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
CcncQ62447 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
CcncQ62447 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
CcncQ62447 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
CcncQ62447 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
CcncQ62447 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
CcncQ62447 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
CcncQ62447 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
CcncQ62447 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
CcncQ62447 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
CcncQ62447 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
CcncQ62447 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
CcncQ62447 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
CcncQ62447 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
CcncQ62447 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
CcncQ62447 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
CcncQ62447 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
CcncQ62447 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
CcncQ62447 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
CcncQ62447 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
CcncQ62447 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
CcncQ62447 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
CcncQ62447 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
CcncQ62447 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
CcncQ62447 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
CcncQ62447 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
CcncQ62447 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
CcncQ62447 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
CcncQ62447 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
CcncQ62447 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
CcncQ62447 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CcncQ62447 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
CcncQ62447 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CcncQ62447 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CcncQ62447 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
CcncQ62447 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,92
CcncQ62447 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
CcncQ62447 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
CcncQ62447 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
CcncQ62447 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
CcncQ62447 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
CcncQ62447 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
CcncQ62447 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,92■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
CcncQ62447 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
CcncQ62447 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
CcncQ62447 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
CcncQ62447 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CcncQ62447 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
CcncQ62447 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
CcncQ62447 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
CcncQ62447 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
CcncQ62447 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
CcncQ62447 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,79■■□□□ 1,88
CcncQ62447 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
CcncQ62447 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
CcncQ62447 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
CcncQ62447 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
CcncQ62447 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
CcncQ62447 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
CcncQ62447 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
CcncQ62447 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
CcncQ62447 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
CcncQ62447 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
CcncQ62447 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
CcncQ62447 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
CcncQ62447 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77,4 ms